代謝組與16S rDNA測序整合分析
代謝組學(xué)是對細胞、生物流體、組織或生物體內(nèi)的小分子(通常稱為代謝物)的大規(guī)模研究。16S rDNA是編碼16S rRNA的基因,存在于所有細菌基因組。16S rDNA既能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,又能利用測序技術(shù)較容易地得到其序列,目前被廣泛用于病原菌的檢測和鑒定,以及不同微生物群落的屬或種系統(tǒng)進化分類。整合分析16S rDNA測序數(shù)據(jù)和代謝組學(xué)數(shù)據(jù),可揭示特定菌群與特定代謝物(群)之間的關(guān)聯(lián)性,篩選引起菌群代謝狀態(tài)或功能性代謝小分子變化的關(guān)鍵菌株。此外,通過代謝組學(xué)和16S rDNA測序整合分析的方法研究代謝物-微生物-疾病之間的關(guān)系,有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物以進一步應(yīng)用于臨床輔助診斷等。如腸道微生物菌群與宿主代謝表型的關(guān)系以及微生物群落如何影響代謝功能的研究,就是代謝組學(xué)與16S rDNA測序記過整合分析的典型案例。
代謝組與16S rDNA測序整合分析流程

應(yīng)用領(lǐng)域
農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,物種保護研究等;
畜牧業(yè):致病機理研究,肉類及乳制品品質(zhì)研究等;
海洋水產(chǎn):漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等;
微生物:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;
生物醫(yī)藥:生物標(biāo)志物,疾病機理機制,疾病分型,藥物開發(fā),個性化治療等;
環(huán)境科學(xué):發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),環(huán)境危害風(fēng)險評估研究等;
食品科學(xué):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質(zhì)鑒定,食品安全監(jiān)檢測等。