通常來說，在靈活用工新業(yè)態(tài)中，服務平臺（如外賣平臺）與服務提供個人（如外賣騎手等）之間，并無直接勞務雇傭關系，充當其間“橋梁”的，就是靈活用工企業(yè)。靈活用工企業(yè)與靈活用工個人構成勞動關系或民事關系，服務平臺則從靈活用工企業(yè)購買服務或要求其代理結算。實踐中，根據(jù)靈活用工企業(yè)與服務平臺簽訂的合同內容來看，存在兩種常見的經(jīng)營模式，即參與經(jīng)營型和中間服務型。

參與經(jīng)營型，指靈活用工企業(yè)作為服務提供方，與服務平臺簽訂合同，向服務購買方直接提供服務。靈活用工企業(yè)與服務提供個人建立合法合規(guī)的用工關系，并為其依法代扣代繳個人所得稅；服務平臺直接向靈活用工企業(yè)支付服務費，靈活用工企業(yè)以服務費全額向服務平臺開具增值稅發(fā)票。

在參與經(jīng)營型模式下，靈活用工企業(yè)的增值稅應稅收入主要來自服務平臺，但因目前監(jiān)管機制有待完善，一些靈活用工企業(yè)通過虛增業(yè)務量，甚至虛構交易方式對外開具增值稅發(fā)票，以獲得非法利益。同時，一些靈活用工企業(yè)利用網(wǎng)絡交易可被刪除、被偽造的漏洞，在個人所得稅扣繳申報時，隱瞞真實勞動關系，按照核定征收率更低的“個人承包經(jīng)營所得”扣繳個稅，很容易產(chǎn)生稅務風險。

中間服務型，由靈活用工企業(yè)充當中介角色，向服務平臺提供“互聯(lián)網(wǎng)+人力資源”服務。靈活用工企業(yè)根據(jù)服務平臺的要求，篩選靈活用工個人，并為服務平臺提供信息查詢、交易撮合、合同簽訂、稅費代繳、費用結算等服務。在這種模式下，靈活用工企業(yè)向服務平臺收取分包勞務費及項目服務費，根據(jù)項目服務費向服務平臺開具增值稅發(fā)票，并在代扣代繳個人所得稅后，將分包勞務費支付給靈活用工個人。這樣，靈活用工企業(yè)收到的款項包括兩部分，一部分是“互聯(lián)網(wǎng)+”服務費，計入靈活用工企業(yè)收入；一部分是靈活用工個人的報酬，靈活用工企業(yè)完成結算后，支付給靈活用工個人。實務中，一些靈活用工企業(yè)將收到的服務費以及勞務費合并開具增值稅發(fā)票，其中不乏虛開發(fā)票風險。