凝膠分析軟件- BandScan——實驗做得好，軟件不可少！
某些圖像不能被識別怎么辦？如何計算分子量和定量分析？如何查看和輸出各種計算結果？等等問題在還沒開始實驗就困擾著你。實驗做得好，軟件不可少！今天小編為大家介紹一款凝膠分析軟件-?BandScan
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它是一款通用的電泳膠條帶定量分析軟件。可以手動、自動找到條帶，手動的條帶可以是無規(guī)則的，可以清除背景。可以進行分子量、百分比、質量、波峰等方面的定量分析。并且直接使用掃描儀。可以將數(shù)據(jù)輸出到excel文件。是一個很常用的凝膠圖像分析軟件，用它分析蛋白表達量。功能包括凝膠圖像分析、光密度掃描、分子量計算、自動查找條帶、雜點去除、電泳遷移校正功能。是一款非常好用的圖像處理類生物軟件。
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BandScan 5.0軟件下載：
鏈接：https://pan.baidu.com/s/1Bpb3gGPQrOGX9Gr4jrDTGA
提取碼：9q5n
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下面就以一個表達的一個蛋白圖來示范這個軟件分析的過程。最后結果是得到目的蛋白占總蛋白的百分數(shù)。
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1、打開一張掃描好的電泳圖。BandScan可以識別TIF和jpG格式的圖片，很方便。打開工具欄上的file/open tiff，jpg file format，選中待分析的圖片。
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2、打開。這時候凝膠圖像顯示出來。1道是低分子量標準，2道是誘導表達的蛋白，3道是未誘導的對照。旁邊有一個圖像預覽窗口Image Preview，可以看到，除了cancal，其它命令框都是灰色的（不可操作）。其實這里是要你先選定一個圖像處理的范圍（select rectangle）。
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3、從凝膠圖左上角按住鼠標左鍵劃到右下角，松開鼠標，劃出的長方形框包擴了整個待分析的范圍。這時，命令框內均變成黑色的（可以操作）。上面那個undo rect可以取消選框，下面的image options可以選擇是否和如何旋轉圖像。本例中均不改動，直接單擊accept selected region。
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4、出現(xiàn)color to signal selections復選框。這個是選擇信號檢測方式，直接用默認的original image，或選擇gray scale（灰階）。本例中不改動，單擊use current image。
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出現(xiàn)如下分析框。它是自動轉換成灰階的。其左上角的數(shù)字是鼠標所在的坐標和灰度值。移動鼠標就可以看到它的變化。
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5、現(xiàn)在讓BandScan來分析一下電泳條帶吧：）打開工具欄上的band finding/find bands，出現(xiàn)一個讓你選擇有幾條泳道的框selecting number of lanes，設置成3道。
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6、當每一個條帶都自動被框起來了：）紅色+記號是條帶的中心位置，蘭色豎線是泳道位置。同時出現(xiàn)了一個復選框select more or select few bands?？梢愿鶕?jù)總灰度、最大灰度和大小為標準來自動選擇蛋白條帶。拉動左邊的滾動條，可以增加或減少條帶的數(shù)量。選好后單擊ok。
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7、現(xiàn)在就可以看看蛋白的表達量了。打開window/band table。出現(xiàn)了一個band location的表格。把它最大化，放到右邊。這里的數(shù)據(jù)是每個條帶的中心位置（紅色+的位置）。
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8、在band location的數(shù)據(jù)類型data type中，選擇percent signal，就會出現(xiàn)各個條帶灰度值占本泳道條帶總灰度值的百分比。
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9、單擊自己的表達條帶，則條帶中心的+和相應的百分數(shù)的背景都會變成綠色。我表達的融合蛋白約占細菌總蛋白的29.8%。我們要的數(shù)據(jù)就得到了。
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BandScan還有其他功能比如通過設定一個條帶的量（標準）來推斷表達蛋白的量、手動方式加入未被自動選擇的條帶等等，更多相關問題，歡迎大家留言討論。
