真核生物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序可以分為有參和無(wú)參的情況。其中，無(wú)參指在無(wú)參考基因組的情況下，對(duì)真核生物轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序。真核無(wú)參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序在獲得原始數(shù)據(jù)后，首先要進(jìn)行質(zhì)控拼接為unigene，再以u(píng)nigene為參考序列進(jìn)行后續(xù)分析，包括功能注釋、SNP、SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)等。也可以對(duì)多個(gè)樣本進(jìn)行差異基因表達(dá)分析和差異基因功能富集分析等，用于發(fā)現(xiàn)功能基因，為下一步研究提供方向。