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小云的單日小技巧DAY9:850K甲基化數(shù)據(jù)的免疫浸潤分析很難嗎?

2023-08-04 09:55 作者:爾云間  | 我要投稿

850K甲基化芯片相對于450K甲基化芯片來說,具有更高的覆蓋度和更好的分辨率。它檢測的位點數(shù)量是450K的兩倍以上,可以檢測到更多的CpG位點和其他類型的位點。另外,850K芯片還能夠覆蓋更多的基因,因此在免疫浸潤分析中,可以更全面地評估基因和免疫細(xì)胞之間的關(guān)系。上一期小云分享了云生信平臺(云生信 ?- 學(xué)生物信息學(xué) (biocloudservice.com))450K甲基化數(shù)據(jù)的免疫浸潤分析方法,本期跟小云一起看看850K甲基化芯片的吧。

【上傳數(shù)據(jù)】

1、Group.850.csv(分組信息)

2、methylation850.csv(不同樣本各甲基化位點得分)

【輸出結(jié)果】

1.?Wilcox.result.csv(包含了經(jīng)過 Wilcoxon rank-sum test 檢驗的差異甲基化位點的統(tǒng)計信息)

2.?Immune.infiltration.result.csv(包含了不同類型免疫細(xì)胞浸潤得分)

3.?B.pdf

4.?meth.DMP.results.csv(差異甲基化位點的分析結(jié)果)

5.?Neutro.pdf

6.?Eosino.pdf

7.?CD4T.pdf

8.?NK.pdf

9.?CD8T.pdf

10.?Mono.pdf

好啦,到這里全部輸出文件就介紹完畢了,生信云平臺同時提供根據(jù)450K和850K兩種甲基化芯片的結(jié)果進(jìn)行免疫浸潤分析。

看了小云的介紹是不是想要迫不及待地試一下了呢?

450K甲基化數(shù)據(jù)的免疫浸潤分析www.biocloudservice.com/789/789.php

850K甲基化數(shù)據(jù)的免疫浸潤分析www.biocloudservice.com/111_850k/111_850k.php






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