蛋白質(zhì)測(cè)序是指測(cè)定蛋白質(zhì)的氨基酸組成和排列順序，也可以稱為蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)分析。目前用于蛋白質(zhì)氨基酸序列分析的方法可以大致分為基于質(zhì)譜的方法和非質(zhì)譜法，Edman降解法是最常用的非質(zhì)譜法。質(zhì)譜法和Edman 降解法基于不同的原理實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的序列分析，二者所能分析的片段也不同，Edman降解法是針對(duì)N末端序列的測(cè)序方法，但是對(duì)于N端封閉的蛋白質(zhì)無(wú)能為力；質(zhì)譜法可用于蛋白從頭測(cè)序、蛋白全序列分析以及蛋白末端（N/C）測(cè)序，N端封閉的蛋白質(zhì)也可測(cè)。簡(jiǎn)而言之，兩者最大的區(qū)別在于分析的原理以及可以分析的序列不同。