WB實驗問題總結(jié)(Western blot)

01.為什么我的細胞提取液中沒有目標蛋白?
答:原因有很多:
a) 你的細胞中不表達這種蛋白質(zhì),換一種細胞;
b) 你的細胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了,你必需加入PMSF,抑制蛋白酶活性;c) 你的抗體不能識別目標蛋白,多看看說明,看是否有問題。
02.我的細胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?
答:a) 有沉淀可能因為你的蛋白沒有變性完全,可以適當提高SDS 濃度,同時將樣品煮沸時間延長;
b) 也不排除你的抗原濃度過高,這時再加入適量上樣緩沖液即可。
03.我做的蛋白質(zhì)分子量很小(10KD),請問怎么做WB?
答:可以選擇0.2μml的膜,同時縮短轉(zhuǎn)移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。
04.我的目的帶很弱,怎么加強?
答:可以加大抗原上樣量。這是最主要的。同時也可以將一抗稀釋比例降低。?
05.膠片背景很臟,有什么解決方法?
答:減少抗原上樣量,降低一抗?jié)舛?,改變一抗孵育時間,提高牛奶濃度。?
06.目標帶是空白,周圍有背景,是為什么?
答:你的一抗?jié)舛容^高,二抗上HRP 催化活力太強,同時你的顯色底物處于一個臨界點,反應(yīng)時間不長,將周圍底物催化完,形成了空白即“反亮現(xiàn)象”。將一抗和二抗?jié)舛冉档?,或更換新底物。
07.我的膠片是一片空白,是怎么回事?
答:如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。a) 二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光;b) ECM底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;c) ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置;d) 二抗失活。?
08.我在顯影液中顯影1分鐘和5分鐘后,底片漆黑一片是什么原因呢?
答:a) 可能是紅燈造成的, 膠片本來就被曝光了,可以在完全黑暗的情況下操作.看是否有改善;b) 顯影時間過長。?
09.DAB好還是ECM好?
答:DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制,但被催化時靈敏度差一點,但如果達到閥值,就特別靈敏,可以檢測pg 級抗原。要看你實驗的情況。?
10.抗原檢測出的分子量比資料上的大,是怎么回事?
答:a)抗原形成了二聚體。增多巰基乙醇量,煮沸變性時間延長,可以打開二聚體;b)蛋白本身的修飾如:糖基化,磷酸化等。?

答:可能是:a)樣品濃度過低;b)轉(zhuǎn)移時間不夠。?
12.磷酸化抗體的檢測樣本制備時是否一定要加NaF等?
答:NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑,一般最好加。但是不加也可以,大部分時候是不用加的。?
13.要驗證某個細胞上有無該蛋白的存在,需要做免疫組化和western blot試驗嗎?做這兩個試驗時的一抗和二抗可以共用嗎?
答:① 免疫組化可以用來進行定位,但是不能精確定量,而且有時會有假陽性,不易與背景區(qū)分;Western blot可以特異性檢測某個蛋白質(zhì)分子,進行定量,但是不能定位。② 兩種實驗的一抗有時候不能通用,公司的產(chǎn)品說明一般都會說明可以進行什么實驗,在免疫組化時,是否適合石蠟切片或者冰凍切片。
14.電泳中常出現(xiàn)的一些現(xiàn)象
︶ 條帶呈笑臉狀原因:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好; 電泳系統(tǒng)溫度偏高。
︵ 條帶呈皺眉狀原因:可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不完全。
拖尾原因:樣品溶解不好。
紋理(縱向條紋)原因:樣品中含有不溶性顆粒。
條帶偏斜原因:電極不平衡或者加樣位置偏斜。
條帶兩邊擴散原因:加樣量過多。?

膜封閉不夠延長封閉的時間;選擇更加適合的封閉液。一抗稀釋度不適宜對抗體進行滴度測試,選擇最適宜的抗體稀釋度。一抗孵育的溫度偏高建議4℃結(jié)合過夜。選擇的膜容易產(chǎn)生高背景一般硝酸纖維素膜的背景會比PVDF膜低。膜在實驗過程中干過實驗過程中要注意保持膜的濕潤。檢測時曝光時間過長減少曝光時間。?
16.Western blot結(jié)果中雜帶較多可能的原因及建議
目的蛋白有多個修飾位點(磷酸化位點、糖基化位點、乙?;稽c等),本身可以呈現(xiàn)多條帶。查閱文獻或進行生物信息學分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白實際大小。目的蛋白有其它剪切本查閱文獻或生物信息學分析可能性。樣本處理過程中目的蛋白發(fā)生降解加入蛋白酶抑制劑;樣本處理時在冰上操作。上樣量過高,太敏感適當減少上樣量。一抗特異性不高重新選擇或制備高特異性的抗體。一抗不純純化抗體一抗或者二抗?jié)舛绕呓档涂贵w濃度。?
17.?Western?blot結(jié)果中無信號或顯示信號弱可能的原因及建議
檢測樣本不表達目的蛋白選擇表達量高的細胞作為陽性對照,用于確定檢測樣本是否為陰性。檢測樣本低表達目的蛋白提高上樣量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制劑。轉(zhuǎn)移不完全或過轉(zhuǎn)移可以用麗春紅染膜并結(jié)合染膠(考馬斯亮藍)后確定條帶是否轉(zhuǎn)至膜上或轉(zhuǎn)移過頭;適當調(diào)整轉(zhuǎn)膜的時間和電流??贵w不能識別測試種屬的相關(guān)蛋白購買抗體前應(yīng)當認真閱讀抗體說明書,確定其是否能夠交叉識別測試種屬的對應(yīng)蛋白。一抗孵育時間不足建議4℃結(jié)合過夜。二抗與一抗不匹配選擇針對一抗來源的種屬的抗體。洗膜過度洗膜時間不宜過長,加入的去垢劑不宜過強或過多,建議使用0.1%的弱去垢劑Tween-20。
18.其它現(xiàn)象
膜上多處出現(xiàn)黑點或黑斑原因:抗體與封閉試劑發(fā)生非特異性的結(jié)合。反白(條帶顯白色)原因:目的蛋白含量太高或者一抗?jié)舛绕?。蛋白分子量偏低或偏高原因:膠濃度不適合,高分子量要用低濃度膠;小分子蛋白要用高濃度膠。?
19.?安全問題
操作有毒試劑時,帶手套和口罩,且操作揮發(fā)性試劑應(yīng)在通風櫥中進行。


作者:海星生物
公眾號:Cas9X細胞基因敲除
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