嫌分析方法太過簡單？

嫌分析思路太過老套？

想要創(chuàng)新升級的快點(diǎn)看過來吧！

話不多說，開門見山，小云今天給大家分享的熱點(diǎn)就是它—氧化應(yīng)激！

從國自然立項(xiàng)情況來看，自2012年以來，每年的中標(biāo)個數(shù)及總金額都是非常可觀，居高不下。

你見沒見過哪個熱點(diǎn)可以持續(xù)熱這么久的？說明氧化應(yīng)激在科學(xué)研究領(lǐng)域中的地位不言而喻。

那么按照慣例，小云肯定要找一篇氧化應(yīng)激相關(guān)的生信文章給大家分享。（沒有思路、不知道怎么創(chuàng)新的找小云，超多個性化、創(chuàng)新性高的分析思路供你選擇！

小云今天就帶你看看一篇亮點(diǎn)多多的氧化應(yīng)激相關(guān)生信文章，難怪發(fā)到7分+了。

亮點(diǎn)包括：

1. 分析了氧化應(yīng)激和免疫相關(guān)的基因，篩選出的關(guān)鍵基因可以作為疾病的診斷標(biāo)志物。

2. 與鐵死亡關(guān)聯(lián)起來；

3. 利用單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析關(guān)鍵基因的細(xì)胞定位。

發(fā)表時間：2022年8月

發(fā)表雜志：Oxidative medicine and cellular longevity

影響因子：IF=7.31

文章題目：動脈粥樣硬化中氧化應(yīng)激和巨噬細(xì)胞鐵死亡相關(guān)的新型診斷生物標(biāo)志物

數(shù)據(jù)信息

研究思路

基于GEO數(shù)據(jù)集分析差異表達(dá)基因（DEGs），與389個氧化應(yīng)激(OS)相關(guān)基因取交集，獲得與氧化應(yīng)激相關(guān)的差異表達(dá)基因（DEOSGs）。利用WGCNA獲得與免疫相關(guān)的關(guān)鍵模塊基因，與DEOSGs取交集得到27個差異表達(dá)的免疫相關(guān)氧化應(yīng)激基因(DEIOSGs)。構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)，篩選到6個hub基因作為AS的診斷標(biāo)志物。

針對這6個hub基因進(jìn)行常規(guī)分析（表達(dá)水平、功能富集、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等）。分別將差異表達(dá)基因(DEGs)和WGCNA關(guān)鍵模塊基因與鐵死亡基因集取交集，得到了2個hub基因。單細(xì)胞分析顯示，2個hub基因主要與巨噬細(xì)胞相關(guān)。最后進(jìn)行了簡單的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

主要研究結(jié)果

1、基于GEO數(shù)據(jù)集分析差異表達(dá)基因（DEGs），與389個氧化應(yīng)激(OS)相關(guān)基因取交集，獲得與氧化應(yīng)激相關(guān)的差異表達(dá)基因（DEOSGs），并進(jìn)行GO和KEGG分析。

2、利用WGCNA獲得與免疫相關(guān)的關(guān)鍵模塊基因，與DEOSGs取交集得到27個差異表達(dá)的免疫相關(guān)氧化應(yīng)激基因(DEIOSGs)。

3、構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)，篩選到6個hub基因作為AS的診斷標(biāo)志物。針對這6個hub基因進(jìn)行常規(guī)分析（表達(dá)水平、功能富集、調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等）。

4、分別將差異表達(dá)基因(DEGs)與鐵死亡基因、壞死性凋亡基因和細(xì)胞焦亡基因取交集，再將WGCNA關(guān)鍵模塊基因與鐵死亡基因，得到了2個hub基因。單細(xì)胞分析顯示，2個hub基因主要與巨噬細(xì)胞相關(guān)。最后進(jìn)行了簡單的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。

總結(jié)

這篇文章有幾個亮點(diǎn)：

1. 分析了氧化應(yīng)激和免疫相關(guān)的基因，進(jìn)行了一系列的常規(guī)分析，證明5個關(guān)鍵基因可以作為AS的診斷標(biāo)志物。

2. 分別與鐵死亡基因、壞死性凋亡基因和細(xì)胞焦亡基因取交集，篩選到了與鐵死亡相關(guān)的關(guān)鍵基因，與鐵死亡關(guān)聯(lián)起來；

3. 利用單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析關(guān)鍵基因的細(xì)胞定位，為后續(xù)課題做基礎(chǔ)。后面可以設(shè)計“ALOX5和NCF2通過調(diào)控巨噬細(xì)胞鐵死亡參與AS壞死核心的形成”等相關(guān)課題。

氧化應(yīng)激、免疫、鐵死亡等多個熱點(diǎn)結(jié)合肯定比單一熱點(diǎn)要增色不少，還證明了關(guān)鍵基因的診斷價值，增加臨床意義。此外，利用單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析關(guān)鍵基因主要是影響哪一種細(xì)胞類型，后續(xù)的研究思路不就有了嘛！

如果你還苦惱于非腫瘤疾病沒有思路，或者嫌分析方法太過簡單、太過老套，想要創(chuàng)新思路的，或者對氧化應(yīng)激/鐵死亡等熱點(diǎn)方向感興趣的小伙伴快來聯(lián)系小云吧！