玉皇寺(玉皇殿)始建于明嘉靖二十四年，歷代香火旺盛，是嵊州自古以來的著名古剎。道光三十年間因地裂倒塌，于咸豐七年重修。

因歷史原因和社會變遷，寺院建筑損毀嚴(yán)重，自一九八二年宗教政策開放以來，宗教文化逐漸復(fù)蘇，僧人與信眾逐年增多，宗教活動日趨頻繁，由于這里香火靈驗，一些善男信女出資重建的玉皇殿，活動場地與食宿均不能滿足日益所需。而如今，艇湖山更是成為了市民生態(tài)休閑、娛樂健身、宗教活動的重要場所，這一矛盾更為突出。

玉皇寺坐北朝南，為石柱船建軒古建筑，門窗原飾古樸典雅的木雕花紋，殿中懸掛著寫“同天福地"四字的篇額，石桌鐫有"清乾隆歲次臘月"的字樣。

殿內(nèi)現(xiàn)存"靈宵殿”重修碑記，此碑立于清咸豐歲次月庚申年臘月，迎峰庵玘重建玉皇殿于今，與明代艇湖塔朝夕相伴，呈現(xiàn)出佛門凈土特有的清幽，肅穆和神圣氣象。

2009年被紹興市民宗局批準(zhǔn)為合法佛教活動場所。

2010年7月被紹興市民宗局授予“和諧寺院”。
為了更進(jìn)一步弘揚(yáng)佛教文化，從2018年開始，玉皇寺民主管理委員會主任黃琴妃攜善男信女等眾信，謀求擴(kuò)建玉皇寺，經(jīng)過大半年的努力，得到了有識之士的大力支持，猶如天降甘露，玉皇寺中興指日可待。

總體結(jié)構(gòu)從原來的三進(jìn)五殿擴(kuò)大到三宮三院——玉皇山天宮道院，星子峰梵宮佛院，鹿胎山法宮觀音院。目前，規(guī)劃設(shè)計、籌集資金，招募人才等工作正在有序進(jìn)行之中。