高大上的熱圖分析,Excel 幫你搞定

對(duì)于生物醫(yī)學(xué)的科研人員甚至是臨床醫(yī)生來(lái)說(shuō),發(fā)表一篇高水平的文章是大家夢(mèng)寐以求的事情。而高質(zhì)量的文章與高大上的數(shù)據(jù)圖密不可分,其中最多的應(yīng)該就數(shù)熱圖了,那如何才能做一張漂亮的熱圖分析呢?
今天小編給大家分享一個(gè)不用 R 語(yǔ)言就能輕松搞定熱圖的方法,只要會(huì)用 Excel 就行。
1. 在 Excel 中輸入自己的原始數(shù)據(jù),比如:

2. 選中數(shù)據(jù),選擇「條件格式」中的「色階」,隨后選擇「其他規(guī)則」。

3. 在彈出的新建格式規(guī)則欄中,我們可以看到格式樣式中有不同選項(xiàng)。為了讓熱圖更加美觀,可以選擇「三色刻度」對(duì)應(yīng)的在類(lèi)型欄中都改為「數(shù)字」。
由于我們的原始數(shù)據(jù)都在 2-8 之間,因此可以將「最小值」,「中間值」和「最大值」分別設(shè)置為 「1」, 「5」 和 「9」。隨后的顏色設(shè)置,可以根據(jù)自己的喜好選擇。
4. 點(diǎn)擊確定后,可以看到以下頁(yè)面。

5. 對(duì)熱圖進(jìn)行優(yōu)化,去掉樣本中的具體數(shù)值,選中樣本中的數(shù)值,鼠標(biāo)右擊后選擇「設(shè)置單元格格式」。

6. 在自定義欄目中,將類(lèi)型改為「#,」去掉樣本數(shù)值,得到如下結(jié)果。隨后將表格復(fù)制為圖片格式,就可以粘貼到 ppt 或者保存為 PDF 格式了。

當(dāng)然,眼尖的小伙伴會(huì)發(fā)現(xiàn)這樣的熱圖不是很好看,中間顏色的延續(xù)性不是很好,不能很好的展示基因在不同樣本中的表達(dá)情況。
7. 因此,一般在繪制熱圖時(shí),需要對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,其中最常見(jiàn)的就是正態(tài)標(biāo)準(zhǔn)化,我們用標(biāo)準(zhǔn)化處理后再試試。正態(tài)標(biāo)準(zhǔn)化處理的公式如下:

8. 首先使用 Excel 函數(shù)公式計(jì)算每個(gè)基因表達(dá)均值 μ。

9. 接下來(lái)計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)差 σ。

10. 計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)化后的值 u。

11. 得到標(biāo)準(zhǔn)化值 u 后,重復(fù)步驟 2-6 操作,在「新建格式規(guī)則」中進(jìn)行相應(yīng)的修改。
12. 確定后得到熱圖如下,隨后將數(shù)字去掉,選中熱圖并以圖片的格式復(fù)制到 ppt 中。

13. 通過(guò)比較標(biāo)準(zhǔn)化前后標(biāo)準(zhǔn)化后的圖,你覺(jué)得哪個(gè)更好看呢?
