輔助檢查有醋酸白實驗、皮膚鏡、陰道鏡、肛門鏡、直腸鏡和尿道鏡、實驗室檢查。

病理學檢查：表皮乳頭瘤樣或疣狀增生，在表皮淺層(顆粒層和棘層上部)可見呈灶狀、片狀及散在分布的空泡化細胞,即凹空細胞。該細胞體積大，核深染，核周胞漿不同程度的空泡化改變。在部分皮損的顆粒層細胞內(nèi)可見到粗大的紫色包涵體顆粒。

對于典型皮損，不必要進行組織病理活檢，但強烈推薦以下人群須行病理學檢查：①診斷不確定；非典型皮損(例如潰瘍、出血、色素沉著、硬化、與周圍組織粘連等)；③經(jīng)標準治療后效果不佳，頑固且容易復發(fā)；④在治療期間病情惡化；⑤巨大尖銳濕疣。(強烈推薦，證據(jù)等級D)

核酸擴增試驗：該試驗利用擴增HPV特異性基因(L1、E6、E7區(qū)基因)來檢測皮損中的HPV。目前有多種核酸檢測方法，包括聚合酶鏈式反應(PCR)、熒光實時PCR、核酸探針原位雜交試驗等。該試驗應在通過相關機構認定的實驗室開展。