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驚!CY3竟然在DNA測序中有這么大的作用!

2023-11-14 19:59 作者:yu-si-yi-yao  | 我要投稿


近紅外熒光染料CY3

激發(fā)波長:555nm

發(fā)射波長:570nm

CY3是一種常用的熒光染料,又被稱為花青染料。它被廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,如顯微鏡成像、流式細(xì)胞儀分析、DNA測序等。

花氰染料CY3(Cyanine 3)在DNA測序中也有應(yīng)用。DNA測序是一種用于確定DNA序列的技術(shù),通過將CY3標(biāo)記于DNA片段上,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA序列的檢測和定位。以下是花氰染料CY3在DNA測序中的應(yīng)用及相應(yīng)的例子:

1. Dye-terminator測序:

在Dye-terminator測序中,每個(gè)堿基被標(biāo)記上不同的熒光染料,其中包括CY3。通過在測序反應(yīng)中使用含CY3的ddNTP(dideoxynucleotide triphosphate),可以將CY3標(biāo)記于DNA片段上的終止堿基位置。隨后,通過電泳或其他方法分離熒光標(biāo)記的DNA片段,可以讀取熒光信號(hào)并確定DNA序列。例如,將CY3標(biāo)記于ddATP上,可以用于測序反應(yīng)中標(biāo)記DNA片段上的A終止位點(diǎn)。

2. 熒光原位雜交(FISH):

FISH是一種使用熒光標(biāo)記的探針來定位染色體或特定DNA序列的技術(shù)。通過將CY3標(biāo)記于FISH探針上,可以將CY3標(biāo)記的探針與目標(biāo)DNA序列雜交,然后觀察并定位目標(biāo)DNA序列的位置。例如,將CY3標(biāo)記于染色體特定探針上,可以用于定位染色體上特定的基因或DNA序列。

3. Next-Generation Sequencing(NGS)測序:

在NGS測序中,通過將CY3標(biāo)記于適配體(adapter)或引物(primer)上,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA片段的測序。適配體或引物上的CY3標(biāo)記可以用于檢測DNA片段的連接或擴(kuò)增過程。例如,在Illumina測序中,適配體上的CY3標(biāo)記可以用于檢測適配體連接的效率和質(zhì)量。

總之,花氰染料CY3在DNA測序中的應(yīng)用包括Dye-terminator測序、熒光原位雜交(FISH)和Next-Generation Sequencing(NGS)測序等。通過將CY3標(biāo)記于DNA片段、探針或適配體上,可以實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA序列的檢測、定位和測序,為DNA研究和基因組學(xué)研究提供了有力的工具。

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