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2022年課程計劃

2022-01-08 01:07 作者:張煒_細菌研究  | 我要投稿

? ? ?雖然說計劃往往趕不上變化,但是計劃還是要認真做的。我的經(jīng)驗是,只要是開始認真去做的事,結(jié)果往往是要超過預(yù)期的。2022年準備開設(shè)/完善以下網(wǎng)課。相關(guān)課程均已經(jīng)開始制作,今年上半年只有一門本科生的開放課,時間相對充裕,只是可能要多赴各地籌備“家用”和“團隊用”的糧草,不過所謂“行萬里路,讀萬卷書”,皆是輸入,均有利于輸出的,并不矛盾。

開設(shè)課程一:噬菌體系列專題

? ? 噬菌體是一種神奇的存在,無論是數(shù)量、地理分布還是分布體系均是迷一般的存在,叫它“生物界的暗物質(zhì)”,非常貼切,本人自十多年前開始涉及此領(lǐng)域,初窺門徑,但每次讀文獻,均感覺自己懂的還太少。所以制作此課程一方面想把自己的所領(lǐng)悟的一點點心得與大家分享,另一方面,是逼著自己學(xué)習(xí)和探索。

0引言:大隱隱于世的噬菌體

專題一:噬菌體的分類體系

專題二:噬菌體分離技術(shù)

專題三:噬菌體基因組及分析

專題四:噬菌體基因操作和編輯技術(shù)

專題五:噬菌體編碼的酶

專題六:前噬菌體

專題七:噬菌體的生產(chǎn)與制劑

專題八:噬菌體表達外源性基因

專題九:噬菌體的臨床應(yīng)用

?其它:噬菌體的細菌分型,噬菌體耐受細菌的篩選及應(yīng)用、噬菌體對生態(tài)的影響,


開設(shè)課程二:生物信息在病原細菌中的應(yīng)用

大數(shù)據(jù)時代真的來了,細菌研究說到底也是屬于數(shù)據(jù)處理和利用的一種流程化操作,從數(shù)據(jù)獲取(細菌的分離、基本特性數(shù)據(jù)以及基因組),到數(shù)據(jù)分析和展示(大數(shù)據(jù)時代只能依靠計算機),再到數(shù)據(jù)應(yīng)用(我研究病原細菌,能應(yīng)用才是我目的,如檢測方法建立、疫苗以及新型抗菌制劑)。這三個流程中,數(shù)據(jù)分析和展示需要大量生物信息學(xué)知識,我這方面的能力不大,心卻很大,準備同時開展我認為最重要的三門語言Bash、R和python的課程。

模塊一:Bash----邊學(xué)邊用并極大的提高分析效率的編程語言

模塊二:R----統(tǒng)計分析以及繪圖利器

模塊三:python:無限可能,無窮擴展


更新課程一:動物病原細菌的致病機制及防控策略

? ? 這門課的網(wǎng)上視頻是2020年制作的,這兩年又有一些積累,這門課是上半年我的一門本科生開放課程,會隨著新學(xué)期這門課的同步更新的。


更新課程二:動物免疫學(xué)

這門課現(xiàn)在的視頻也是2020年的,也需要更新的,這門課是我下半年的本科生和研究生的課程,也會隨著上課同時更新的。

其它的專題

分子細菌學(xué)中還有很多章節(jié)沒有完成,比如鏈球菌、肺炎克雷伯、鮑曼不動桿菌、銅綠假單胞菌、單增李斯特、彎曲桿菌等等。

其它我覺得有意義的專題,比如“神奇的雞蛋”,“Alphafold2在疫苗研究中的暢想”,“2000塊錢二手筆記本的生信之路”,“荒原野犬的科研修仙”等等。



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