HiC-Pro的作用是把測序文件輸出為標準互作圖譜，軟件非常靈活，不僅可以處理各種不同建庫方式的Hi-C數(shù)據(jù)，也可以處理capture Hi-C數(shù)據(jù)。

昨天安裝Hic-Pro軟件安裝了一天，又是安裝R，又是配置Python包，又試了是Conda，還是出問題，總是找不Python依賴：

Can not proceed without the required Python libraries, please install them and re-run

如下圖：

晚上給課題組做生信的老師說了一下情況，老師一會就安好了，給我說了一下github上給示例的建立conda環(huán)境的作用，今天早上又試了一下，才解決。簡單記錄一下安裝步驟及我遇見的問題總結(jié)。

一?、HiC-Pro軟件安裝

首先一個非常重要的問題，現(xiàn)在的Hic-Pro已經(jīng)開始依賴python3了，網(wǎng)上很多的帖子還是python2，很快就不會再支持Python2了，一點要注意：我們看一下github上的描述吧：

Github地址：https://github.com/nservant/HiC-Pro

Conda建立HiC-Pro運行的依賴環(huán)境，按照github上說明，

在自己的software目錄下運行如下命令：

運行成功

二、報錯總結(jié)：

我在用conda建立HiC-Pro運行的運行環(huán)境后，開始用make configure? 還是會報錯，找不到Python的依賴，這個時候注意config-install.txt文件里面內(nèi)容。

如果用conda建立的依賴環(huán)境，這個文件不需要做任何修改，直接make congfigure就可以了。

如果是自己手動配置HiC-Pro運行環(huán)境，就去修改config-install.txt文件，指定依賴的位置。

我之所以一直報錯，就是用conda安裝了運行環(huán)境，還去修改了config-install.txt文件，結(jié)果不行。

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