夢中情師竟在東京大學？

生物科學專攻?教授情報大揭秘

說不定“入江直樹“就是你的神仙教授

日本留學 頂尖名校

東大生物科學研究室

正在和你say hello：）

好不容易熬到日本疫情逐漸平穩(wěn)的美好局面，自2019年開始的這場風波，不知燃起了多少熱血少年想要學習生物 / 醫(yī)學的心。「生物科學」，這個學科不僅和生物學完美掛鉤，還能讓你嘗遍跨專業(yè)領域融合的美好滋味，可以說是大學院理科考生從萬眾競爭者中脫穎而出的神仙專業(yè)。

最近給到不少文科學部以及大學院的干貨，知日自然也不能忘了留給理科同學們的福利。今兒，知日就扔給你一個可以讓你笑得合不攏嘴的大！福！利！全宇宙僅有一份的寶藏研究室大盤點！史無前例的東大生物科學專攻33位教授揭秘：）

01?

WHY東京大學？

東京大學，也就是人見人愛、誰見誰都夸的東大，是日本七所帝國大學之首的日本最高學術殿堂，也是是日本第一所以現(xiàn)代學制成立的綜合大學。作為日本文部科學省“超級國際化大學計劃”A類頂尖名校，東大也是東亞研究型大學協(xié)會、學術研究懇談會、卓越研究生院計劃、領先研究生院計劃的成員。

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截止今年，東大在QS世界大學排名中仍然保持前列，綜合實力穩(wěn)居日本第1位、亞洲第6名，世界排名第23名。截至2021年，東京大學已經(jīng)培養(yǎng)了12名諾貝爾獎得主、6名沃爾夫獎得主、1名菲爾茲獎得主、16位日本首相、以及21位帝國國會議長。

02

生物科學究竟玩什么？

生物科學，顯而易見，主要進行以分子水平到細胞器、細胞、組織、器官、個體、集團水平的各種生物現(xiàn)象為素材的教育和研究。該專攻的研究手法囊括了分子生物學、分子遺傳學、分子進化學、生物物理學、細胞生物學、發(fā)育生物學、生理學、形態(tài)學、生態(tài)學、系統(tǒng)分類學、群體遺傳學等等，可以說是研究手法相當豐富、研究內容也極其廣泛。

近年，以動物為特征的高級結構和功能表達機制的研究、基因?/?蛋白質以及細胞器?/?細胞?/?組織?/?器官等相關研究、以闡明人類作為進化產(chǎn)物的人類生物學研究、以及分子細胞個體與集團等各階層的進化生物學相關研究都是近年來的主要關注以及研究課題。

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生物科學專業(yè)的同學們，不僅可以選擇進入相關工業(yè)或者醫(yī)藥等企業(yè)就職，也可以考慮進行與生物相關的應用研究以及管理等行業(yè)，當然與生物相關的跨專業(yè)領域也是當下以及未來的熱門之選。

03?

WHY東大的生物科學？

東京大學的生物科學專攻以本鄉(xiāng)校區(qū)的理學部1、2號館以及淺野校區(qū)的理學部3號樓為中心，并囊括了彌生校區(qū)、白金校區(qū)、柏校區(qū)、三崎臨海實驗所、小石川和日光植物園，總共有約300名大學院生在籍。值得注意的是，在東大這個學霸聚集的神仙寶地，與生物學息息相關的教員&教授，多達3位數(shù)！而生物科學專攻的大學院學生數(shù)僅為188人，能在東大實現(xiàn)1對1教學指導真的不是夢！

由于東大對于擁有跨專業(yè)背景的學生的報考持有非常開放的態(tài)度，東大的生物科學專攻可以說是現(xiàn)代生物學發(fā)展的多元以及融合的典型代表。雖然東京大學的生物科學專業(yè)于2014年由原有的生物化學專業(yè)與生物科專攻整合而成，已有7年的教學經(jīng)驗了。雖然看起來建立時間并不是很長，但有不少可以在生物科學業(yè)界視為天花板存在的教授臥虎藏龍于此。

東大的生物學專攻設置有生物化學講座、光計測生命學講座、生物學講座三個主要基干講座，專注于研究從微觀到宏觀的各種生命現(xiàn)象，鼓勵學生通過分子生物學、細胞生物學、生理學、生態(tài)學、基因組科學、數(shù)理統(tǒng)計學等多種多樣的方法論進行各自的課題研究。

?生物化學講座

生物化學講座致力于通過分子、遺傳基因來理解并分析生命現(xiàn)象的普遍機制，是一個從生物學和信息科學入手、闡明生命系統(tǒng)的生物信息科學領域。主要的研究課題有小分子RNA對表觀遺傳基因的調節(jié)控制、腦神經(jīng)系統(tǒng)等個體形成的局部基因表達、功能以及相互作用結構、膜輸送體、受體和酶等各種蛋白質結構的發(fā)揮功能等與生物信息學以及系統(tǒng)生物學相關內容。

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?光計測生命學講座

光計測生命學講座與生物化學講座有所不同，它涉及到最先進的以光為主要載體所進行研究的光生命科學。簡單來說，小到核酸、蛋白質、細胞等構成因子，大到腦功能和行動等高級功能控制，都將光成像、光操作、分子測量等方法論對大量數(shù)據(jù)進行精密的觀測、開發(fā)和推進應用。該講座不僅與專業(yè)內的生物化學講座、生物學講座有著緊密的合作，還和本校的物理學、化學等相關領域也有積極的接觸。

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?生物學講座

生物學講座聽起來和生物化學講座略有相似，但更偏向從分子小層面到細胞、組織、器官、個體、群體大層面所涉及的多樣生物現(xiàn)象入手進行教學以及各種以人為對象的研究。該講座的研究方向也是出奇的多，分子生物學、分子遺伝學、分子進化學、生化學、生物物理學、細胞生物學、生理學、形態(tài)學等都是其不可缺少的入手研究方法。

04?

說說那些寶藏研究室

· 生物化學講座分野研究室?·

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①飯野 雄一 教授?/?IINO Yuichi

研究方向：分子行動遺伝學

??研究室鏈接

http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JTop.html

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飯野雄一教授擅長利用線蟲進行與行動遺傳學相關的神經(jīng)系統(tǒng)構造以及其相關機能的研究。通過對小小線蟲的分析，教授甚至可以展開到對生物的學習以及記憶結構、感官接收等神經(jīng)系統(tǒng)相關的信息處理、“反復無常的行動”發(fā)生機制的闡明、信息素引起的個體間相互作用與種內、種間多樣性等復雜的課題。

近期研究發(fā)表：

2021 May. 25 Glutamate signaling from a single sensory neuron mediates experience-dependent bidirectional behavior in C. elegans., Hirofumi Sato, Hirofumi Kunitomo, Xianfeng Fei, Koichi Hashimoto, Yuichi Iino., Cell Reports. Volume 35, Issue 8, 25 May 2021, 109177DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109177

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2021 Jan. 27 Roles of the ClC chloride channel CLH-1 in food-associated salt chemotaxis behavior of C. elegans, Chanhyun Park, Yuki Sakurai, Hirofumi Sato, Shinji Kanda, Yuichi Iino, Hirofumi Kunitomo., Elife. 2021 Jan 25;10:e55701DOI: 10.7554/eLife.55701

②濡木 理?教授?/?NUREKI Osamu

研究方向：構造生命科學

??研究室鏈接

http://www.nurekilab.net/

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濡木理教授專注于在原子分解水平上理解各種生命現(xiàn)象。具體來說，首先學生將需要通過X射線晶體結構的分析，來確定生物學上重要的蛋白質?核酸的立體結構。同時，基于由此得到的信息，建立關于功能表達機制的假設。最后，在進行in vitro以及in vivo的變異體分析的同時驗證假設的成立與否。目前，「非翻訳RNA関連」、「膜蛋白質」以及「信號轉導與癌癥」都是該研究室的主要研究中心。

近期研究發(fā)表：

"Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex." Okamoto HH, Miyauchi H, Inoue A, Raimondi F, Tsujimoto H, Kusakizako T, Shihoya W, Yamashita K, Suno R, Nomura N, Kobayashi T, Iwata S, Nishizawa T, Nureki O, Nat Struct Mol Biol, (2021).

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"Cryo-EM structure of the beta3-adrenergic receptor reveals the molecular basis of subtype selectivity." Nagiri C, Kobayashi K, Tomita A, Kato M, Kobayashi K, Yamashita K, Nishizawa T, Inoue A, Shihoya W, Nureki O, Mol Cell, (2021).

③塩見 美喜子?教授?/?SIOMI?Mikiko

研究方向：RNA生物學

??研究室鏈接

http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/

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對于塩見美喜子教授來說，無論是什么生物，都會在進化的同時形成獨自的基因情報。該研究室在以果蠅為對象進行研究同時，發(fā)現(xiàn)由20~30堿基長度的“小非編碼RNA”驅動的RNA警報素機制、在保護生殖細胞基因組信息和維持個體生殖能力方面起到的核心作用。現(xiàn)在，哺乳動物的生殖細胞也被列入研究對象之中，主要探討生殖組織中小分子RNA的生物合成機制、轉位子在生殖細胞中的表達抑制機制、以及小鼠生殖細胞中的表觀基因組形成過程。

近期研究發(fā)表：

Onishi R, Yamanaka S, Siomi MC.piRNA- and siRNA-mediated transcriptional repression in Drosophila, mice, and yeast: new insights and biodiversity EMBO Rep. 2021; e53062 EMBO Rep. doi: doi.org/10.15252/embr.202153062

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Chikuma S, Yamanaka S, Nakagawa S, UEDA MT, Hayabuchi H, Tokifuji Y, Kanayama M, Okamura T, Hisashi A, Yoshimura A. TRIM28 Expression on Dendritic Cells Prevents Excessive T Cell Priming by Silencing Endogenous Retrovirus J. Immunol. 2021; ji2001003 J. Immunol. doi: doi.org/10.4049/jimmunol.2001003

④黒田 真也?教授?/?KURODA Shinya

研究方向：システム生物學

??研究室鏈接

http://kurodalab.bs.s.u-tokyo.ac.jp/en/top_en/

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黒田真也教授的研究室旨在通過系統(tǒng)層面，理解多種細胞功能的生物信號轉導網(wǎng)絡的信號機制調節(jié)。同時，鼓勵學生對各種生物學過程背后的信號網(wǎng)絡，進行編碼與解碼的數(shù)理機制進行研究。該研究室同時使用濕實驗和干實驗的方法，從系統(tǒng)生物學的角度來嘗試認識細胞過程。目前，黒田教授研究室的主要研究課題囊括了葡萄糖代謝的貫穿組學分析、胰島素效應的時間編碼、細胞間信號的信息理論等。

近期的研究成果

Ohashi, K., Fujii, M., Uda, S., Kubota, H., Komada, H., Sakaguchi, K., Ogawa, W. and Kuroda, S., (2018). Increase in hepatic and decrease in peripheral insulin clearance characterize abnormal temporal patterns of serum insulin in diabetic subjects. npj Systems Biology and applications. 4:14. doi:10.1038/s41540-018-0051-6

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Yugi, K., Kuroda, S., (2018). Metabolism as a signal generator across trans-omic networks at distinct time scales. Current Opinions in Systems Biology. 8: 59-66. doi: 10.1016/j.coisb.2017.12.002

⑤角田 達彥?教授?/?TSUNODA?Tatsuhiko?

研究方向：醫(yī)科學數(shù)理

??研究室鏈接

http://mesm.bs.s.u-tokyo.ac.jp/

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角田達彥教授相對其他教授來說，更加偏醫(yī)學生物，他擅長通過分析生物分子的龐大數(shù)據(jù)，來解釋癌癥等疾病的免疫相關生物現(xiàn)行并探索各種疾病的克服方案以及預防疾病的干預方式。通過混合數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)、臨床信息等方式，了解癌癥和與癌癥相關的免疫微環(huán)境之間的關系。目前，通過綜合組學分析以發(fā)現(xiàn)新的生命現(xiàn)象、綜合組學分析發(fā)現(xiàn)疾病的新原因、對生物圖像和組學結構的理解都是該研究室的主要研究課題。

近期研究發(fā)表：

Sharma A, Lysenko A, Boroevich KA, Vans E, Tsunoda T. DeepFeature: feature selection in nonimage data using convolutional neural network. Briefings in Bioinformatics. 2021 Aug 6: bbab297. doi: 10.1093/bib/bbab297. Online ahead of print.

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Murakami T, Tanaka N, Takamatsu K, Hakozaki K, Fukumoto K, Masuda T, Mikami S, Shinojima T, Kakimi K, Tsunoda T, Sawada K, Imamura T, Mizuno R, Oya M. Multiplexed single-cell pathology reveals the association of CD8 T-cell heterogeneity with prognostic outcomes in renal cell carcinoma. Cancer Immunology, Immunotherapy. 2021 Jul 14. doi: 10.1007/s00262-021-03006-2. Online ahead of print.

⑥程 久美子?教授?/?UI-TEI?Kumiko?

研究方向：ゲノム情報生物學

??研究室鏈接

http://ui-tei.rnai.jp/

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程久美子教授的研究室，擅長通過基因情報等作用機序，解析RNA的各種新興機制的同時，來分析分子生物學、生化學以及細胞生物學?；蛱禺愋?、siRNA的非對稱區(qū)域特異性作用、人體基因的siRNA庫構筑、miRNA向細胞核輸送的分子機制以及miRNA抑制機制及其定量分析都是主要研究方向。

近期研究發(fā)表：

Shiomi A, Nagao K, Yokota N, Tsuchiya M, Kato U, Juni N, Hara Y, Mori MX, Mori Y, Ui-Tei K, Murate M, Kobayashi T, Nishino Y, Miyazawa A, Yamamoto A, Suzuki R, Kaufmann S, Tanaka M, Tatsumi K, Nakabe K, Shintaku H, Yesylevsky S, Bogdanov M, UmEDA M. (2021) doi: 10.3390/genes12020271

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Kobayashi Y, Miyamoto K, Aida M, Ui-Tei K. (2021) Selection of chemical modifications in the siRNA seed region that repress off-target effect. Methods in Molecular Biology, Design and Delivery of SiRNA Therapeutics, 2282, 17-30. [PDF] doi: 10.1007/978-1-0716-1298-9_2

⑦杉村 薫?教授?/?SUGIMURA Kaoru

研究方向：多細胞秩序形成學

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http://www.koolau.info/

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杉村薫教授的研究室特別關注「在塑造身體時，細胞是如何相互推動、拉動并觸發(fā)組織的精確變形的？」這一問題。他鼓勵學生通過結合機械、遺傳干擾、實時成像和貝葉斯推斷等方法，研究上皮形態(tài)發(fā)生調控的物理原則。機械力對個體發(fā)育控制、哺乳動物培養(yǎng)細胞群體模式形成、多細胞集團力學定量手法的開發(fā)都是該研究室的重要課題。

近期研究發(fā)表：

Takeru Takagi, Tasuku Ueno, Keisuke Ikawa, Daisuke Asanuma, Yusuke Nomura, Shin-nosuke Uno, Toru Komatsu, Mako Kamiya, Kenjiro Hanaoka, Chika Okimura, Yoshiaki Iwadate, Kenzo Hirose, Tetsuo Nagano, Kaoru Sugimura, and Yasuteru Urano. Visualization and Manipulation of Actin Cytoskeleton with Small-Molecular Probes. Submitted (2020)

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Keisuke Ikawa and Kaoru Sugimura.AIP1 and cofilin ensure a resistance to tissue tension and promote directional cell rearrangement. Nature Communications 9: 3295 (2018).

⑧豊島 有?教授?/ TOYOSHIMA Yu

研究方向：システム神経科學

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https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~toyoshimalab/

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豊島有教授是東大除了飯野雄一教授以外，另一位通過線蟲進行生物學研究的教授。但與其不同的是，豊島有教授的著眼點更傾向于生物的神經(jīng)科學。豊島有教授鼓勵學生通過線蟲對周邊鹽濃度的感知反應實驗，解析對線蟲的行動有抑制作用的神經(jīng)系統(tǒng)，并以此在線神經(jīng)系統(tǒng)的模型、找出其情報處理機構的動作原理。

近期研究發(fā)表：

Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Chanhyun Park, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino. Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans. BMC BIOLOGY 18 (1).?Submitted (2020)

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Moon Sun Jang, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino. Multiple sensory neurons mediate starvation-dependent aversive navigation in Caenorhabditis elegans. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 116(37) 18673-18683 (2019).

· 光計測生命學講座?·

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①深田 吉孝?教授?/ FUKADA Yoshitaka

②小島 大輔?教授?/ KOJIMA Daisuke

研究方向：神経機能生化學

??研究室鏈接

http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/fukada-lab/index-j.html

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以深田吉孝教授為主導人、 小島大輔為講師的研究室主要關注點在于對視網(wǎng)膜和大腦中樞神經(jīng)系統(tǒng)中光信號的接收、轉換和傳輸的分子機制，致力于分析分子運動原理中個體分子的生理機能。目前，該研究室的研究課題主要有生物鐘系統(tǒng)的分子分析、記憶形成和生物鐘功能的關聯(lián)、視網(wǎng)膜的光信號轉導以及大腦感光分子的功能分析。

近期研究發(fā)表：

Yohey Ogawa, Tomoya Shiraki, Yoshitaka Fukada, Daisuke Kojima. Foxq2 determines blue cone identity in zebrafish. Science advances 7 (41) eabi9784. (2021)

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Takashi Ogino, Naoya Matsunaga, Takahiro Tanaka, Tomohito Tanihara, Hideki Terajima, Hikari Yoshitane, Yoshitaka Fukada, Akito Tsuruta, Satoru Koyanagi, Shigehiro Ohdo. <?Post-transcriptional repression of circadian component CLOCK regulates cancer-stemness in murine breast cancer cells >. eLife 10 (2021)

③上村 想太郎?教授?/ UEMURA Sotaro

研究方向：1分子遺伝學

??研究室鏈接

http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/uemura-lab/japanese/home_ja.html

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1分子遺伝學可能會讓很多同學感到迷惑，其實1分子指的就是單分子、單細胞。上村想太郎教授主要對分子及細胞的個體個性進行研究。他提倡通過使用可以詳細研究單個細胞或分子的個體性的獨創(chuàng)技術，進行疾病的個體化診斷、藥物開發(fā)、分子機制闡明等。目前研究室的主要研究方向有關于1分子可視化技術對基因的調控機制、以及通過1細胞成像技術闡明細胞功能等。

近期研究發(fā)表：

Y. Oguchi*, H. Shintaku, and S. Uemura* Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single molecule resolution Commun. Biol., 3, 788 (2020)

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N. Nitta, T. Iino, A. Isozaki, M. Yamagishi, Y. Kitahama, S. Sakuma, Y. Suzuki, H. Tezuka, M. Oikawa, F. Arai, T. Asai, D. Deng, H. Fukuzawa, M. Hase, T. Hasunuma, T. Hayakawa, K. Hiraki, K. Hiramatsu, Y. Hoshino, M. Inaba, Y. Inoue, T. Ito, M. Kajikawa, H. Karakawa, Y. Kasai, Y. Kato, H. Kobayashi, C. Lei, S. Matsusaka, H. Mikami, A. Nakagawa, K. Numata, T. Ota, T. Sekiya, K. Shiba, Y. Shirasaki, N. Suzuki, S. Tanaka, S. Ueno, H. Watarai, T. Yamano, M. Yazawa, Y. Yonamine, D. D. Carlo, Y. Hosokawa, S. Uemura, T. Sugimura, Y. Ozeki, and K. GodaRaman image-activated cell sorting Nature Commun., 11, 3452 (2020)

④榎本 和生?教授?/ EMOTO Kazuo

⑤鈴木 郁夫 教授?/?SUZUKI Ikuo

研究方向：脳機能學

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http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~brain/

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榎本和生教授和鈴木郁夫教授帶領的研究室，致力于通過遺傳要素與環(huán)境要素對腦神經(jīng)系統(tǒng)的影響的分析，提煉出個人的個性、情感表達以及精神疾病的發(fā)展形成過程。該研究室以老鼠、果蠅和人體的ES / iPS 細胞為研究模型，通過運用生物成像、數(shù)理建模、AI機器學習等最新方法，對腦神經(jīng)網(wǎng)絡的形成、發(fā)展、再生結構進行研究。

近期研究發(fā)表：

Nao Utashiro, Claire Williams, Jay Parrish, Kazuo Emoto.?Prior activity of olfactory receptor neurons is required for proper sensory processing and behavior.?Scientific Reports; 8: 8580

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長谷川恵理?北谷育子?柳學理?榎本和生，「神経突起の選択的除去メカニズム」特集：スクラップ＆ビルドで発達する脳神経回路と高次脳機能，実験醫(yī)學36號: 1978-1986 (2018).

⑥東山 哲也 教授?/?HIGASHIYAMA Tetsuya

⑦吉田 大和 教授?/?YOSHIDA Yamato

研究方向：発生細胞生物學

??研究室鏈接

https://www.devcell-u-tokyo.bio/

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以東山哲也教授和吉田大和教授為首的発生細胞生物學研究室，倡導通過開發(fā)最佳的生物材料和創(chuàng)新的技術，來研究從廣泛的生物現(xiàn)象到高層次的生命現(xiàn)象等課題。該研究室目前的主要研究有：轉位子裝置的分子結構和工作原理、真核生物新型細胞分裂調控分子、組蛋白操作與分析技術的開發(fā)以及化學領域等的不同領域融合研究。

近期研究發(fā)表：

Kimata Y., Kato T., Higaki T., Kurihara D., Yamada T., Segami S., Morita M.T., Maeshima M., Hasezawa S., Higashiyama T., Tasaka M. UEDA M. (2019) Polar vacuolar distribution is essential for accurate asymmetric division of Arabidopsis zygotes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116, 2338-2343.?https://doi.org/10.1073/pnas.1814160116

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Ohno M., Ando T., Priest D.G., Kumar V., Yoshida Y., Taniguchi Y. (2019) Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs. Cell 176, 520-534.e25. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.014

· 生物學講座?·

①角谷 徹仁?教授?/?KAKUTANI?Tetsuji

②稲垣 宗一?教授?/ INAGAGI Soichi

研究方向：遺伝學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~iden/

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角谷徹仁教授和稲垣宗一教授的這個研究室與其他的研究室有些不同，他們從植物入手，進行遺傳學和表觀遺傳學的研究。該研究室主要使用和分裂酵母為實驗對象，研究遺傳和表觀遺傳機制，通過遺傳學方法、基因組學和生物化學分析的相結合，對表觀基因組進行進一步的探究。

近期研究發(fā)表：

Inagaki S, Takahashi M, Takashima K, Oya S, Kakutani T (2021) Chromatin-based mechanisms to coordinate convergent overlapping transcription. Nature Plants 7, 295-302. Pubmed

To TK, Nishizawa Y, Inagaki S, Tarutani Y, Tominaga S, Toyoda A, Fujiyama A, Berger F, Kakutani T. (2020) RNA interference-independent reprogramming of DNA methylation in Arabidopsis. Nature Plants 6, 1455-1467. Pubmed

③久保 健雄?教授?/ KUBO Takeo

④國枝 武和 教授?/?KUNIEDA Takekazu

研究方向：細胞生理化學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~saibou/

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久保健雄教授和國枝武和教授主要分為3大板塊。該研究室的重點中的重點就是通過對蜜蜂社會性行動的分子神經(jīng)基礎的解析，展開對大腦領域以及遺傳活動的深入研究。另外，爪蟾幼生尾再生的分子機制、蝮蛇對極端環(huán)境的耐受性的分子層面的研究等也是當下該研究室的主要課題。

近期研究發(fā)表：

Iino S, Shiota Y, Nishimura M, Asada M*, Ono, M* and Kubo T*.?(2020) Neural activity mapping of bumble bee (Bombus ignitus) brains during foraging flight using immediate early genes. Sci. Rep. in press.

Kumagai H?, KuniEDA T?, Nakamura K?, Matsumura Y?, Namiki M, Kohno H, Kubo T. (2020) Developmental stage-specific distribution and phosphorylation of Mblk-1, a transcription factor involved in ecdysteroid-signaling in the honey bee brain. Sci. Rep. in press.

⑤武田 洋幸 教授?/?TAKEDA Hiroyuki

⑥入江 直樹 教授?/?IRIE Naoki.

研究方向：動物発生學

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http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~hassei/

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武田洋幸教授和入江直樹教授（夢中情師竟在東大？）的研究室，則使用斑馬魚等小型魚類進行對脊椎動物初期發(fā)生過程中的體軸形成、器官形成機制的分析。同時，研究室還加入了斑馬魚基因組計劃的深入探討，以促進對脊椎動物的基因組進化的研究。目前，該研究室的主要課題有體軸形成及器官形成的基本原理、演化與發(fā)生的一般關系規(guī)律的闡明以及母嬰間微節(jié)律對母嬰發(fā)生的影響等。

近期研究發(fā)表：

Ryohei Nakamura, Yuichi Motai, Masahiko Kumagai, Candice L. Wike, Haruyo Nishiyama, Yoichiro Nakatani, Neva C. Durand, Kaori Kondo, Takashi Kondo, Tatsuya Tsukahara, Atsuko Shimada, Bradley R. Cairns, Erez Lieberman Aiden, Shinichi Morishita, Hiroyuki TakEDA, CTCF looping is established during gastrulation in mEDAka embryos. Genome Research, 31:968-980. (2021).

Candice L. Wike, Yixuan Guo, Mengyao Tan, Ryohei Nakamura, Dana Klatt Shaw, Noelia Díaz, Aneasha F. Whittaker-Tademy, Neva C. Durand, Erez Lieberman Aiden, Juan M. Vaquerizas, David Grunwald, Hiroyuki TakEDA, Bradley R. Cairns, Chromatin architecture transitions from zebrafish sperm through early embryogenesis. Genome Research, 31:981-994. (2021).

⑦塚谷 裕一 教授?/?TSUKAYA Hirokazu

研究方向：発生進化

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https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~bionev2/

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塚谷裕一教授是另一位為數(shù)不多的對植物進行展開式研究的教授。該研究室的主要關注點便是樹葉的發(fā)育和進化。迄今為止，該研究室通過擬南芥確定了控制葉片形狀和大小的重要基因，可以說是領先于世界其他地區(qū)。同時，在塚谷教授的帶領下，更是發(fā)現(xiàn)了植物的補償作用機制。目前，該研究室著重于研究調節(jié)樹葉形態(tài)的遺傳基因群及其控制網(wǎng)絡、以及葉片自適應形態(tài)進化的基因背景等。

近期研究發(fā)表：

An auxin signaling network translates low-sugar-state input into compensated cell enlargement in the fugu5 cotyledonTabeta H, Watanabe S, Fukuda K, Gunji S, Asaoka M, Hirai MY, Seo M, Tsukaya H, Ferjani APLoS Genet. 2021 Aug 5;17(8):e1009674. doi: 10.1371/journal.pgen.1009674. PMID: 34351899.

Identification of the unique molecular framework of heterophylly in the amphibious plant Callitriche palustris LKoga H, Kojima M, Takebayashi Y, Sakakibara H,Tsukaya H. Plant Cell. 2021 Jul 27: koab192,?https://doi.org/10.1093/plcell/koab192

⑧近藤 修?教授?/?KONDO Osamu

研究方向：形態(tài)人類學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitai/

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近藤修教授的形態(tài)人類學，其實就是通過人體骨骼以及牙齒的形態(tài)、對人類的進化、人類群體的變異以及適應能力進行展開式研究。目前，該研究室主要的研究課題有西亞尼安德特人與現(xiàn)代型智人的系統(tǒng)關系與交替、土耳其新石器時代人體的骨骼特征與墓葬、繩文人及北海道阿伊努的人類學等。

近期研究發(fā)表：

Kuwamura K. (2002) Sexual and populational difference in humeral muscle insertions between Jomon people and recent Japanese. Inter-Congress of IUAES 2002 Tokyo.

Kondo O, and Ishida H. (2003) Ontogenetic variation in the Dederiyeh Neandertal infants: Postcranial evidence. In Patterns of Growth and Development in the Genus Homo, ed. Thompson JL, Krovitz GE and Nelson AJ. Cambridge: Cambridge University Press. pp.386-411.

⑨荻原 直道 教授?/?OGIHARA Naomichi

?研究方向：人類進化生體力學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~ogihara/

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荻原直道教授旨在從力學的角度了解人體肌肉骨骼結構的適應性，在闡明人類特有的例如直立雙足和精確抓取能力等運動功能的演變的同時，也推動研究肌肉骨骼疾病的預防和治療。該研究室的研究方法包括基于CT等醫(yī)學斷層圖像的三維形態(tài)分析等生物力學分析、以動作捕捉系統(tǒng)及高速攝像機對力傳感器的運動分析，以及基于肌肉骨骼模型的物理運動的計算機模擬。

近期研究發(fā)表：

Pina, M., Kikuchi, Y., Nakatsukasa, M., Nakano, Y., Kunimatsu, Y., Ogihara, N., Shimizu, D., Takano, T., Tsujikawa, H., Ishida, H.: New femoral remains of Nacholapithecus kerioi: Implications for intraspecific variation and Miocene hominoid evolution, Journal of Human Evolution, Vol.155, 102982, (2021/6)

Chen, T-Y., Kawakami, T., Ogihara, N., Hosoda, K., Free moment induced by oblique transverse tarsal joint: investigation by constructive approach, Royal Society Open Science, Vol.8, 201947, (2021/4)

⑩太田 博樹 教授?/ OTA Hiroki

研究方向：ゲノム人類學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~genomeanthro/

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太田博樹教授也是人類學研究的導師之一，但更多的是通過基因入手。通過從古老的生物遺跡中提取和純化DNA，用測序儀進行測序。該研究室最新的一項成就便是繩紋人類的全基因組測序草案。此外，主要研究的課題還有古代基因組分析、少數(shù)生產(chǎn)族的基因組分析、以及人類和麩質食物的來源和新陳代謝相關遺傳分析。

近期研究發(fā)表：

Kae Koganebuchi, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Kuniaki Haneji, Takashi Toma, Hajime Ishida, Keiichiro Joh, Hidenobu Soejima, Shuhei Mano, Motoyuki Ogawa, Hiroki Oota*An Analysis of the demographic history of the risk allele R4810K in RNF213 of moyamoya diseaseAnnals of Human Genetics (2021) doi:10.1111/ahg.12424

R. Schmidt*, K. Wakabayashi, D. Waku, T. Gakuhari, K. Koganebuchi, M. Ogawa, J. Karsten, M. Sokhatsky, H. Oota*Analysis of ancient human mitochondrial DNA from Verteba Cave, Ukraine: insights Into the origins and expansions of the Late Neolithic-Chalcolithic Cututeni-Tripolye Culture.Anthropological Sciences (2020) doi: 10.1537/ase.200205

?杉山 宗隆?教授?/ SUGIYAMA?Munetaka

?伊藤 恭子?教授?/ ITO Kyoko

研究方向：生體制御

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seigyo/

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雖然杉山宗隆教授和伊藤恭子教授的研究室合并為同一個研究室，但是研究方向卻各有不同。杉山宗隆教授主要負責植物器官的形成與再生等相關分子機制；而伊藤恭子教授則主要研究產(chǎn)生植物器官和組織模式的細胞間與細胞內的信號、以及對改變細胞發(fā)育機制基因的尋找。

近期研究發(fā)表：

Kurataka Otsuka, Akihito Mamiya, Mineko Konishi, Mamoru Nozaki, Atsuko Kinoshita, Hiroaki Tamaki, Masaki Arita, Masato Saito, Kayoko Yamamoto, Takushi Hachiya, Ko Noguchi, Takashi UEDA, Yusuke Yagi, Takehito Kobayashi, Takahiro Nakamura, Yasushi Sato, Takashi Hirayama, Munetaka Sugiyama (2021) Temperature-dependent fasciation mutants provide a link between mitochondrial RNA processing and lateral root morphogenesis. eLife. 10: e61611. (DOI 10.7554/eLife.61611)

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Ohashi-Ito, K. and Fukuda, H.Transcriptional networks regulating root vascular development. Curr. Opin. Plant. Biol., 57: 118-123.

?寺島 一郎?教授?/?TERASHIMA Ichiro

?小口 理一?教授?/?OGUCHI Riichi

研究方向：植物生態(tài)學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seitaipl/

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由寺島一郎教授和小口理一教授組成的研究室，旨在通過對構成植物生產(chǎn)基礎的光合系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、透水性等方面的解析，從分子到個體、再到生態(tài)系統(tǒng)的各個層面，對植物的環(huán)境響應、環(huán)境適應等能力進行全方位的闡述，有助于在未來將要面對的高二氧化碳和變暖環(huán)境中，提高作物的生產(chǎn)力。研究對象主要有擬南芥等具有代表性的植物、水稻等主要作物、戶外生長的木本植物和酵母等。

近期研究發(fā)表：

Kitagawa T, Matsumoto A, Terashima I, Uesono Y (2021) Antimalarial quinacrine and chloroquine lose their activity by decreasing cationic amphiphilic structure with a slight decrease in pH. Journal of Medicinal Chemistry (in press)

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Funayama-Noguchi S, Shibata M, Noguchi K, Terashima I (2021) Effects of root morphology, respiration and carboxylate exudation on carbon economy in two non‐mycorrhizal lupines under phosphorus deficiency. Plant, Cell and Environment 44: 598–612.?

?上島 勵?教授?/?UESHIMA Rei

研究方向：進化系統(tǒng)學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitou/lab.html

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上島勵教授的研究室主要以軟體動物為研究對象，通過分子生物學以及線粒體DNA基因組結構分析等形態(tài)學方法，研究后生動物的進化和系統(tǒng)的分類。目前，該研究室的研究內容主要分為基于mtDNA基因組結構的無脊椎動物系統(tǒng)分析、陸產(chǎn)貝類的物種分化研究、以及軟體動物的分類及分子系統(tǒng)的解析。

近期研究發(fā)表：

Ueshima, R. and Asami, T. (2003) Single gene speciation by left-right reversal. Nature 425: 679. (doi:10.1038/425679a) [Abstract and PDF]

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Lydeard, O., Holznagel, W. E., Ueshima, R. and Kurabayashi, A. (2002) Systematic implications of extreme loss or reduction of mitochondrial LSU rRNA helical-loop structures in gastropods. Malacologia 44: 349-352.

?土松 隆志 教授?/?TSUCHIMATSU?Takashi

研究方向：植物進化學

??研究室鏈接

https://tsuchimatsu.wordpress.com/

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土松隆志教授的研究室將“在生物中發(fā)現(xiàn)的各種巧妙機制和形式是如何進化的”作為研究入手點，以植物的繁衍機制為研究對象，從而分析對生命表達形狀以及進化有著重要影響的基因組。目前，該研究室主要進行「基于基因組數(shù)據(jù)的植物自適應進化機制扽探究」「被子植物多種生殖系統(tǒng)的進化」「接合藻類中基因組結構和交配方式的進化」等課題的研究。

近期研究發(fā)表：

Kurata, S., Sakaguchi, S., Mishima, H., Tsuchimatsu, T., and Ito M. (2021) Development and characterization of nuclear microsatellite markers to reveal the neutral demographic background of flower color polymorphism in Geranium thunbergii (Geraniaceae), Genes & Genetic Systems.

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Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Setoguchi H., Watano, Y., Sato, S., and Tsuchimatsu, T. (2020) Massive rhizobial genomic variation associated with partner quality in Lotus–Mesorhizobium symbiosis. FEMS Microbiology Ecology 96: fiaa202.

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?井原 泰雄 教授?/?IHARA Yasuo

研究方向：進化人類學

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~shinkajin/

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井原泰雄教授的強項不僅有進化人類學，還有數(shù)理生物學。他致力于通過使用數(shù)理生物學技術、來解析與人類行為進化相關的各種問題。該研究室主要是通過數(shù)學模型分析和計算機模擬等方法，加深對早期人類社會進化、人屬認知進化和現(xiàn)代人類文化進化的每一個理解。

近期研究發(fā)表：

Takahashi T, Ihara Y.. application of a Markovian ancestral model to the temporal and spatial dynamics of cultural evolution on a population network.?Theoretical Populatoin Biology (2021).

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Kobayashi H, Kobori O, Ihara Y, Yaguchi H, Yasuda T..?Understanding ostensive behavior in making inferences of referential intentions. Letters on Evolutionary Behavioral Science (2021).

?大橋 順?教授?/?OHASHI Jun

研究方向：ヒトゲノム多様性

??研究室鏈接

http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~humgendiv/

大橋順教授擅長基于囊括統(tǒng)計分析、數(shù)學分析等在內的理論研究、和與基因組多樣性分析相關的實驗的結合，分析人類進化史、基因型與表型之間的關系以及分子進化機制。當下階段，該研究室主要對自然選擇對基因組的影響、種群起源、遷移和混血過程、 傳染病和人類遺傳適應、以及大洋洲區(qū)域的體型和脂質代謝研究相關的多態(tài)性進行分析和研究。

近期研究發(fā)表：

Isshiki M, Naka I, Kimura R, Nishida N, Furusawa T, Natsuhara K, Yamauchi T, Nakazawa M, Ishida T, Inaoka T, Matsumura Y, Ohtsuka R, Ohashi J. 2021. Admixture with indigenous people helps local adaptation: admixture-enabled selection in Polynesians. BMC Ecology and Evolution (in press).

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Isshiki M, Watanabe Y, Ohashi J. 2021. Geographic variation in the polygenic score of height in Japan. Human Genetics (in press).

知日溫馨提示：

最后再嘮叨一句！生物科學這門學科，對于英語文獻閱讀和發(fā)表能力、實驗操作與設計能力、發(fā)現(xiàn)問題并分析解決問題的能力等均有較高的要求。特別是東大這種學霸比比皆是的bao寶藏神仙地，除了良好的日語溝通能力，英語在交流和學術論文上也是無！比！重！要！

知日塾王牌生物/藥學講師

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于老師東京大學 基礎醫(yī)學 博士

哈佛大學 生物學 修士

教學經(jīng)驗6年+

輔導數(shù)十位學生考上東京大學等一流院校

多年輔導藥學、生物相關專業(yè)的課程

從知識點到做題技巧

都總結了自己的解題技巧

熱切希望能與學生們分享

于老師經(jīng)驗豐富、教學成績優(yōu)異

曾輔導數(shù)十位學生考上東大

東醫(yī)齒等基礎醫(yī)學王牌名校

其耐心細致的授課風格與專業(yè)的講解

也贏得了眾多學生的喜愛

對于東大的生物科學你還有疑問？

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