官方蘇聯(lián)劇本后續(xù)：

盟軍和蘇聯(lián)軍隊(duì)摧毀了尤里在羅馬尼亞的要塞，并極大地削弱了心靈軍團(tuán)的力量，為世界贏回了和平與安全。所有的心靈控制器都被摧毀了，全人類都脫離了被尤里完全心靈控制的陰云。

然而不幸的是，尤里在蘇盟聯(lián)軍開始搜索他之前，就已經(jīng)從要塞逃走。他本打算用愛因斯坦教授設(shè)計(jì)了用來拯救世界的時(shí)間機(jī)器逃脫，不過由于蘇聯(lián)人將剩下的所有能量都填充進(jìn)了時(shí)間機(jī)器，將尤里送到了白堊紀(jì)。尤里被困在了時(shí)間之中，面前是一只饑餓的暴龍以及沒有能量的時(shí)間機(jī)器。但是，誰又看到他被這個(gè)白堊紀(jì)生物吃掉了?

得到尤里被困在了過去的消息后，心靈軍團(tuán)在撒哈拉沙漠的秘密指揮中心的總指揮用精銳部隊(duì)找到了愛因斯坦教授的另一部時(shí)間機(jī)器，并用來解救他們的主人——在尤里被消滅后，愛因斯坦繼續(xù)他的時(shí)空實(shí)驗(yàn)。心靈軍團(tuán)很快就控制了保護(hù)著時(shí)間機(jī)器和一部空間傳送球的衛(wèi)隊(duì)。他們很快就將這兩個(gè)裝置充電，就像他們主人一樣回到了白堊紀(jì)，并找到了尤里。

搜索尤里并沒有花多少時(shí)間，因?yàn)樗麄儗⒁粋€(gè)小型的心靈探測(cè)器傳送到了過去并很快就接收到了尤里的時(shí)間機(jī)器發(fā)出的信號(hào)，雖然時(shí)間機(jī)器已經(jīng)沒有能量了。尤里很快被救回到他被困在時(shí)間里的幾個(gè)月后。

為了防止再次失敗，尤里決定利用他的心靈控制和催眠技術(shù)，來改進(jìn)將會(huì)給他帶來對(duì)世界的絕對(duì)控制的致命武器。他決定重新建造一個(gè)由改進(jìn)的心靈控制器—心靈支配儀（心靈控制器+心靈信標(biāo)）所組成的網(wǎng)絡(luò)，并用它們控制世界上最強(qiáng)大的國(guó)家，實(shí)現(xiàn)他全球統(tǒng)治的夢(mèng)想。他的計(jì)劃包括重新奪回克隆設(shè)施——在泰伯瑞娜人工島——心靈軍團(tuán)基地遺跡的地下克隆設(shè)施里藏著一個(gè)用來代替尤里在前線作戰(zhàn)的英雄。當(dāng)盟軍和蘇聯(lián)尚無準(zhǔn)備的時(shí)候，尤里在太平洋某處制造了這個(gè)變異戰(zhàn)士——拉恩。

一個(gè)新的時(shí)代開始了，但是心靈支配儀組成的網(wǎng)絡(luò)和幾乎完美的變異戰(zhàn)士并不是尤里終極計(jì)劃的全部。

幾個(gè)月過去了，在這期間，蘇聯(lián)完成了新的太空計(jì)劃，并同盟軍結(jié)盟。盟軍和蘇聯(lián)決定停止一切戰(zhàn)爭(zhēng)行為，并形成一個(gè)強(qiáng)大的聯(lián)盟來打擊一切能導(dǎo)致他們失去已得利益的勢(shì)力。并且雙方都在和平地發(fā)展自己的軍隊(duì)并制造出了大量的新式裝備。

不過，一年之后，蘇聯(lián)發(fā)現(xiàn)了自己以及其他紅色國(guó)家境內(nèi)的心靈軍團(tuán)。不久，蘇聯(lián)就遭到心靈軍團(tuán)的全面入侵。

莫斯科在一種不知名的隱形坦克（魔影坦克）的大舉進(jìn)攻下淪陷。這些坦克很快就破壞了蘇聯(lián)的核子反應(yīng)爐和雷達(dá)。羅曼洛夫總理在他看見尤里仍然活著回來的時(shí)候大驚失色，蘇聯(lián)試圖自己抵抗尤里的進(jìn)攻，但心靈軍團(tuán)很快就控制了整個(gè)蘇聯(lián)及其鄰國(guó)。

尤里已經(jīng)控制了紅色政權(quán)的心臟——蘇聯(lián)，而其他的蘇維埃國(guó)家也正遭受尤里的其他心靈軍團(tuán)部隊(duì)的進(jìn)攻。尤里的心靈阻斷技術(shù)是蘇聯(lián)淪陷的主要原因。心靈阻斷技術(shù)裝備坦克時(shí)可以讓他們隱形，輕松地穿越防御并直接從他們脆弱的基地內(nèi)部發(fā)起進(jìn)攻。

克里姆林宮被心靈軍團(tuán)占領(lǐng)并作為尤里的指揮部。其他蘇維埃國(guó)家也幾乎被其他心靈軍團(tuán)完全占領(lǐng)。蘇軍的殘余部隊(duì)逃到了烏拉爾山脈一帶，他們必須聯(lián)系盟軍。但這還不是最糟的，他們還不知道尤里的新裝置。

盟軍知道心靈軍團(tuán)還沒有被完全摧毀并且成功地控制了蘇聯(lián)時(shí)，已經(jīng)是尤里跟白宮聯(lián)系并向盟軍各國(guó)領(lǐng)導(dǎo)人問好的時(shí)候了。他們知道了有人偷走了他們的二號(hào)時(shí)間機(jī)器。當(dāng)活著的尤里跟他們進(jìn)行電視談話時(shí)，全世界都震驚了，甚至比羅曼洛夫更加震驚。

尤里說，他已經(jīng)比當(dāng)年更加強(qiáng)大并且蘇聯(lián)已經(jīng)到了他的手上，因?yàn)樗呀?jīng)控制了整個(gè)蘇維埃帝國(guó)以及全部的蘇軍。他說，不久盟軍也將像蘇聯(lián)一樣被擊敗，因?yàn)樗呀?jīng)有了一件超級(jí)秘密武器。在他說完最后一個(gè)字時(shí)，電視談話終止了。不久，所有華盛頓居民都看到了部署在華盛頓的心靈支配儀被激活，并開始釋放心靈波......

尤里宣布了一個(gè)偉大的帝國(guó)的建立——厄普西隆第五帝國(guó)，世界上有史以來最強(qiáng)大的軍隊(duì)將聽從他的指揮。蘇聯(lián)幾乎被厄普西隆的軍隊(duì)消滅了，美國(guó)的大部分國(guó)土也都已經(jīng)受到心靈控制，甚至杜根總統(tǒng)和盟軍的高級(jí)將領(lǐng)也服從于尤里。

但是，尤里并沒有取得勝利。蘇聯(lián)的最后軍隊(duì)仍然屯聚在烏拉爾山的4G基地，一個(gè)尤里的心靈控制波無法影響的地方。他們?nèi)匀挥邢Ｍ?，他們知道，盟軍和蘇聯(lián)仍然擁有足夠的力量來阻止尤里，并且雙方都將試圖這么做。

當(dāng)尤里還在白堊紀(jì)并且心靈軍團(tuán)還沒有進(jìn)攻他們時(shí)，他們已經(jīng)開發(fā)出了不少先進(jìn)武器，他們將能夠在同尤里的最后決戰(zhàn)中消滅尤里。但是，他們知道他們真正的對(duì)手是什么嗎?沒人知道尤里和第五帝國(guó)在南極的冰雪之下的秘密武器。

在任務(wù)模式中，玩家若選擇蘇軍或盟軍，那么將帶領(lǐng)所選陣營(yíng)對(duì)抗尤里，直至摧毀心靈終結(jié)儀，取得最后勝利；玩家如果選擇厄普西隆，那么將在尤里的威脅下成為厄普西隆最高指揮官，擊敗盟軍與蘇軍，統(tǒng)一世界。但是，指揮官會(huì)如此輕易地屈服嗎?