前言

　　在用Gaussian對分子做結(jié)構(gòu)優(yōu)化時，若要固定（凍結(jié)）某些變量（如原子坐標、鍵長和鍵角等），則被稱作“限制性優(yōu)化”，反之為“全優(yōu)化”。本文講解其中固定原子坐標的方法，具體有三種。

1. 圖形化界面固定原子

　　整個流程如圖1所示，具體操作如下：

　　選中要固定的原子——右擊面板——Edit（16版為Tools）——Atom Groups

　　新面板下拉Atom Group Class選擇Freeze——點擊Freeze (Yes)行的“+”號（此時原子被固定）——點擊“OK”確認

2. 用“-1”固定原子

　　用記事本打開.gjf輸入文件，未固定原子坐標的文件如圖2左側(cè)所示。若要固定某些原子，只需在特定原子坐標前手動添加“-1”；不需要固定的原子添加“0”（也可以省略不寫），如圖2右側(cè)文件所示。本方法實際上和方法1等價。

3. 用“opt=readopt”固定原子

　　上述兩種方法（本質(zhì)上是同一種方法）需要一個個選定原子，對于大分子來說，有時較為麻煩。而本方法則便捷得多，具體方法是：在指令行“#”后寫入“opt=readopt”，在坐標矩陣后添加“notatoms=[要固定的原子]”一行。

　　其中，“notatoms=”后面可以寫原子符號（如圖中的S），也可以寫原子的標簽號（如圖中的2號原子，4到6號原子），用英文逗號隔開。

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