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【青蓮聚焦】空間蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)上線:揭開蛋白質(zhì)的空間密碼

2023-08-02 16:00 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

在細胞和組織內(nèi)部,蛋白質(zhì)的位置和相互作用非常重要,它們直接關(guān)系著細胞的結(jié)構(gòu)和功能。傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)存在一定的局限性,首先是細胞類型的異質(zhì)性方面,傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)由于是對整塊組織進行處理,因此得到的質(zhì)譜結(jié)果是多種細胞中蛋白質(zhì)的mix數(shù)值,不能體現(xiàn)具體是哪種細胞的差異;其次是腫瘤異質(zhì)性方面,同一腫瘤中可存在有很多不同的基因型或亞型的細胞。因此,我們需要一種能夠分析蛋白在不同空間位置表達的新技術(shù),這就是空間蛋白質(zhì)組學(xué)。


空間蛋白質(zhì)組學(xué)是指通過在樣本不同空間位置的區(qū)域進行取樣,分析蛋白在不同空間位置的表達量;與全組織水平的分析相比,空間蛋白質(zhì)組學(xué)可以獲得組織內(nèi)不同細胞和功能區(qū)域的蛋白表達譜;與單細胞水平的分析相比,空間蛋白質(zhì)組學(xué)可以獲得空間位置特異性的蛋白表達信息;空間蛋白質(zhì)組學(xué)可以精細獲得組織內(nèi)不同細胞和功能區(qū)域的蛋白表達譜。通過將空間與細胞類型信息與蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)聯(lián)系起來,從而深入了解組織空間微環(huán)境并發(fā)現(xiàn)更精準(zhǔn)的生物標(biāo)志物和新的功能機制。


圖1:空間蛋白質(zhì)組學(xué)“生命科學(xué)”的下一個風(fēng)口


空間蛋白質(zhì)組學(xué)解決的問題

1、樣本在不同的空間位置進行取樣,分析蛋白在不同空間位置的表達量;

2、與傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)組學(xué)相比較,可以得到不同的細胞和區(qū)域的蛋白質(zhì)組的數(shù)據(jù);

3、可以進行全景式掃描,進行組織空間蛋白質(zhì)水平的全覆蓋;


空間蛋白質(zhì)組學(xué)原理

核心在于通過高精度激光捕獲顯微切割技術(shù)?(LCM)?技術(shù)切取感興趣的組織區(qū)域或細胞,經(jīng)過優(yōu)化的超微量樣本無損提取并酶切蛋白為肽段,進而使用高靈敏度質(zhì)譜,分析蛋白在不同空間位置的表達特征。


圖2:空間蛋白質(zhì)組學(xué)原理


空間蛋白質(zhì)組學(xué)分析技術(shù)流程

主要的實驗流程包括冰凍組織、OCT 包埋(蠟塊)、切片、染色選擇區(qū)域、切割、收集切割區(qū)域、蛋白前處理(蛋白質(zhì)酶切)、質(zhì)譜檢測、數(shù)據(jù)分析。


圖3:空間蛋白質(zhì)組分析實驗流程

通過空間蛋白質(zhì)組學(xué)的研究,我們可以更全面地了解蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)的角色和功能,揭示細胞的結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)聯(lián)。這一領(lǐng)域的不斷發(fā)展和技術(shù)的不斷進步,將為我們深入探索生物系統(tǒng)的奧秘提供強有力的工具和手段??臻g蛋白質(zhì)組學(xué)的前景令人期待,它有望在各個領(lǐng)域帶來重大的突破和進展。


技術(shù)特點與優(yōu)勢

1、MMI 激光顯微切割系統(tǒng),高精度激光捕獲顯微切割技術(shù)?(LCM)?技術(shù)助力切取感興趣的組織區(qū)域或細胞;

2、利用單細胞處理流程,做到無損前處理;

3、青蓮百奧引進timsTOF HT(國內(nèi)首裝),超高超靈敏的4D系統(tǒng),較上一型號,增加了離子蓄集,提供更寬的動態(tài)范圍;

4、專業(yè)的生信團隊,負責(zé)的售后技術(shù),一條龍服務(wù)。


可接受樣本類型及送樣標(biāo)準(zhǔn)

適用的樣本類型:新鮮組織、冰凍樣本、甲醛固定組織、包埋蠟塊、FFPE


空間蛋白質(zhì)組學(xué)高分文獻

關(guān)于空間蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)就先介紹到這里,針對該技術(shù),小編也整理了近些年的高分文獻,希望能給您提供一些思路~

(公眾號回復(fù)關(guān)鍵詞“空間蛋白質(zhì)組學(xué)”獲取最新文獻)


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