傳統(tǒng)的轉錄調控涉及轉錄因子、輔助因子、Pol II等數(shù)以千計的蛋白，結合在難以想象空間中，主要在啟動子區(qū)，各自發(fā)揮功能、達到共同效果？還是精密調控，實現(xiàn)共同目標？迄今為止，尚無定論。

Cisse應用光激活定位顯微鏡證實活細胞中存在轉錄凝聚體，“可聚可溶、底物與產(chǎn)物依賴”的相分離為轉錄調控機制提出新理論見解。

國內(nèi)學者，報道相分離對基因轉錄調控新機制，與神經(jīng)突觸可塑性形成、自噬作用等重要活動相關。

染色質相分離，可能是染色質活性轉化機制的一種解釋，核小體被修飾是染色質相分離的關鍵。

相分離思路對于轉錄調控機制解釋不僅僅是狀態(tài)變化，可能因與增強子作用，使研究者不得不在三維空間思考轉錄調控過程，考慮復雜的轉錄調控復合物協(xié)同作用機制。