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生物化學整理真題之RNA

2023-09-28 00:06 作者:生物yes  | 我要投稿

【已考察】

1、(2012細胞名詞解釋)snRNPS【核小核糖核蛋白,指的是包含有RNA的核蛋白,即將核酸和蛋白質(zhì)結(jié)合在一起的一種形式,核糖核蛋白包括核糖體、端粒酶以及小核RNP(snRNP)?!?/p>

2、(2007生化名詞解釋)RNA剪接和可變剪接【RNA剪接是指從mRNA前體中去除內(nèi)含子的過程??勺兗艚邮侵甘褂貌煌募艚游稽c,從同一mRNA前體中得到不同的剪接體的過程?!?/p>

3、(2007生化簡答題)什么是反義RNA?真核生物中反義RNA調(diào)節(jié)基因表達的機理是什么?【反義RNA是指與目標RNA具有互補序列的RNA分子。反義RNA通過序列互補與特定的mRNA結(jié)合,從而抑制mRNA的翻譯。根據(jù)反義RNA的作用機制可將其分為3類:Ⅰ類反義RNA直接作用于靶mRNA的S D序列和(或)部分編碼區(qū),直接抑制翻譯,或與靶mRNA結(jié)合形成雙鏈RNA,從而易被RNA酶Ⅲ 降解;Ⅱ類反義RNA與mRNA的非編碼區(qū)結(jié)合,引起mRNA構(gòu)象變化,抑制翻譯;Ⅲ類反義RNA則直接抑制靶mRNA的轉(zhuǎn)錄?!?/p>

4、(2007生化簡答題)試列舉5種真核生物中存在的RNA,并概括它的功能?!劲俎D(zhuǎn)運RNA:轉(zhuǎn)運氨基酸②核糖體RNA:參與蛋白質(zhì)翻譯③信使RNA:蛋白質(zhì)合成模板④不均一核RNA:成熟mRNA的前體⑤小核RNA:參與hnRNA的剪接⑥小核仁RNA:參與rRNA的修飾⑦反義RNA:調(diào)節(jié)基因表達⑧微小RNA:調(diào)節(jié)基因表達⑨小干擾RNA:調(diào)節(jié)基因表達⑩核酶:tRNA和rRNA的加工】【分子第三章課后題】

5、(2007生化簡答題)簡述真核生物與原核生物mRNA的主要差別。【①真核生物的mRNA5'端有“帽子”結(jié)構(gòu),3'端有poly(A)尾巴結(jié)構(gòu),原核生物一般沒有②原核生物mRNA可以編碼幾個多肽,真核只能編碼一個,原核生物以多順反子的形式存在,真核生物以單順反子的形式存在③原核生物以AUG作為起始密碼子,有時候以GUG、UUG作為起始密碼子,真核幾乎永遠以AUG作為起始密碼④原核生物的mRNA半衰期短,真核生物的mRNA半衰期長⑤真核生物多含有內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄后的m前體需要加工為成熟的mRNA后才能被翻譯】 【分子第三章課后題】

6、(2008生化簡答題)RNA的生物學功能有哪些?其生物學意義是什么?【RNA主要有五方面功能:①控制蛋白質(zhì)合成②作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾③基因表達與細胞功能調(diào)節(jié)④生物催化與其他細胞持家功能⑤遺傳信息的加工與進化。其生物學意義:RNA具有諸多功能,無不相關(guān)著生物體的生長于發(fā)育,其核心在于基因表達的信息加工和調(diào)節(jié)?!?/p>

7、(2009生化名詞解釋)RNA編輯【指的是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,編輯的結(jié)果導致DNA所編碼的遺傳信息的改變。RNA編輯雖然不是很普遍,但在真核生物中有時也發(fā)生?!?/p>

8、(2010生化名詞解釋)RNA干擾【是利用一段特異的雙鏈RNA或單鏈反義RNA,通過注射、轉(zhuǎn)染、或轉(zhuǎn)基因的方式導入細胞,或模式生物中,使得mRNA無法翻譯成相應的蛋白質(zhì),達到制備某一基因突變體的目的。該方法實驗周期較短,但有時特異性不夠強。】

9、(2011生化簡答題)RNA功能的多樣性?【RNA主要有五方面功能:①控制蛋白質(zhì)合成②作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾③基因表達與細胞功能調(diào)節(jié)④生物催化與其他細胞持家功能⑤遺傳信息的加工與進化。其生物學意義:RNA具有諸多功能,無不相關(guān)著生物體的生長于發(fā)育,其核心在于基因表達的信息加工和調(diào)節(jié)?!?/p>

10、(2012生化名詞解釋)非編碼RNA【非編碼RNA是指不編碼蛋白質(zhì)的RNA。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等多種已知功能的 RNA,還包括未知功能的RNA。這些RNA的共同特點是都能從基因組上轉(zhuǎn)錄而來,但是不翻譯成蛋白,在RNA 水平上就能行使各自的生物學功能了?!?/p>

(2012生化簡答題)如何看待RNA功能的多樣性?它們的核心作用是什么?【RNA主要有五方面功能:①控制蛋白質(zhì)合成②作用于RNA轉(zhuǎn)錄后加工與修飾③基因表達與細胞功能調(diào)節(jié)④生物催化與其他細胞持家功能⑤遺傳信息的加工與進化。其生物學意義:RNA具有諸多功能,無不相關(guān)著生物體的生長于發(fā)育,其核心在于基因表達的信息加工和調(diào)節(jié)?!?/p>

(2013生化簡答題)什么是非編碼RNA?非編碼RNA有哪幾類?舉例說明非編碼RNA的作用?!痉蔷幋aRNA是指不編碼蛋白質(zhì)的RNA。這些RNA的共同特點是都能從基因組上轉(zhuǎn)錄而來,但是不翻譯成蛋白,在RNA 水平上就能行使各自的生物學功能了。非編碼RNA 從生物學功能上來劃分可以分為持家非編碼RNA和調(diào)控性非編碼RNA:持家非編碼RNA主要包括核糖體RNA(rRNA)、轉(zhuǎn)運RNA(tRNA)、小核RNA(snRNA)、小核仁RNA(snoRNA)、引導RNA(gRNA)和端粒酶,調(diào)控性非編碼RNA主要包括小干擾RNA(siRNA)、微小RNA(microRNA)、與piwi蛋白質(zhì)互相作用的piRNA和長鏈非編碼RNA(lncRNA)?!?/p>

(2014生化簡答題)簡述MicroRNA的特點及近幾年的研究現(xiàn)狀?【MicroRNA 是一類21-23 nt 的小RNA,其前體大概是70-100 nt 左右,形成標準的stem 結(jié)構(gòu),加工后成為21-23 nt 的單鏈RNA。microRNA 的作用機制是與mRNA 互補,讓mRNA 沉默或者降解?,F(xiàn)在流行的RNAi技術(shù)就是利用了細胞體內(nèi)的這個機制,在體外人工加入類似microRNA 的smallRNA 來沉默對應的mRNA?!?/p>

(2015生化名詞解釋)小分子干擾RNA:小干擾RNA有時稱為短干擾RNA或沉默RNA,是一個長20到25個核苷酸的雙股RNA,在生物學上有許多不同的用途。目前已知siRNA主要參與RNA干擾(RNAi)現(xiàn)象,以帶有專一性的方式調(diào)節(jié)基因的表達。此外,也參與一些與RNAi相關(guān)的反應途徑。

(2015生化簡答題)基因敲除與RNA干擾引起的基因沉默的異同點?【RNA干擾是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA誘發(fā)的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象?;虺聊?,主要有轉(zhuǎn)錄前水平的基因沉默(TGS)和轉(zhuǎn)錄后水平的基因沉默(PTGS)兩類:TGS是指由于DNA修飾或染色體異染色質(zhì)化等原因使基因不能正常轉(zhuǎn)錄;PTGS是啟動了細胞質(zhì)內(nèi)靶mRNA序列特異性的降解機制。有時轉(zhuǎn)基因會同時導致TGS和PTGS?!?/p>

(2015生化問答題)簡述MicroRNA的作用機制及生理意義?【MicroRNA 是一類21-23 nt 的小RNA,其前體大概是70-100 nt 左右,形成標準的stem 結(jié)構(gòu),加工后成為21-23 nt 的單鏈RNA。microRNA 的作用機制是與mRNA 互補,讓mRNA 沉默或者降解。】

(2016生化名詞解釋)mRNA編輯【RNA編輯泛指轉(zhuǎn)錄后RNA上的修飾和加工導致DNA所編碼的遺傳信息發(fā)生改變,因為經(jīng)過編輯的mRNA序列發(fā)生了不同于模板的DNA的變化?!?/p>

(2016生化簡答題)RNA干擾現(xiàn)象的重要特征有哪些?【在非哺乳動物中,只需要通過目的基因的體外轉(zhuǎn)錄得到所需要的dsRNA,在通過浸泡、注射或轉(zhuǎn)染靶細胞即可實現(xiàn)RNAi。而在哺乳動物中,經(jīng)過Dicer的加工,細胞中較長的雙鏈RNA首先被降解為21-25個核苷酸的小分子干擾核糖核酸(siRNA),其5’端有磷酸基團和3’端有羥基,兩條鏈的3’端各有兩個堿基突出于末端,由siRNA中的反義鏈指導合成沉默復合體(RISC)的核蛋白體,再由RISC介導切割目的mRNA分子中與siRNA反義鏈互補的區(qū)域,從而實現(xiàn)干擾基因表達的功能。】

(2017生化簡答題)真核生物與原核生物的mRNA的區(qū)別?【①真核生物的mRNA5'端有“帽子”結(jié)構(gòu),3'端有poly(A)尾巴結(jié)構(gòu),原核生物一般沒有②原核生物mRNA可以編碼幾個多肽,真核只能編碼一個,原核生物以多順反子的形式存在,真核生物以單順反子的形式存在③原核生物以AUG作為起始密碼子,有時候以GUG、UUG作為起始密碼子,真核幾乎永遠以AUG作為起始密碼④原核生物的mRNA半衰期短,真核生物的mRNA半衰期長⑤真核生物多含有內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄后的m前體需要加工為成熟的mRNA后才能被翻譯】 【分子第三章課后題】

(2017生化問答題)RNA編輯的概念及其生物學意義?【RNA編輯指的是某些RNA,特別是mRNA的一種加工方式,如插入、刪除或取代一些核苷酸殘基,導致DNA所編碼的遺傳信息發(fā)生改變,因為經(jīng)過編輯的mRNA序列發(fā)生了不同于模板的DNA的變化。其生物學意義有:①校正作用:有些基因在突變過程中丟失的遺傳信息可以通過RNA編輯得以修復②調(diào)控翻譯:通過編輯可以構(gòu)成或者去除起始密碼子和終止密碼子,是基因表達調(diào)控的一種方式③擴充遺傳信息:能夠使基因產(chǎn)物獲得新的結(jié)構(gòu)與功能,有利于生物的進化。】



【拓展】


1、LncRNA:非編碼RNA是指不編碼蛋白質(zhì)的RNA。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA 和microRNA 等多種已知功能的 RNA,還包括未知功能的RNA。這些RNA的共同特點是都能從基因組上轉(zhuǎn)錄而來,但是不翻譯成蛋白,在RNA 水平上就能行使各自的生物學功能了。

2、siRNA:小干擾RNA,有時稱為短干擾RNA(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),是一個長20到25個核苷酸的雙股RNA,在生物學上有許多不同的用途。目前已知siRNA主要參與RNA干擾(RNAi)現(xiàn)象,以帶有專一性的方式調(diào)節(jié)基因的表達。

3、snRNA:小核RNA,是細胞內(nèi)有小核RNA。它是真核生物轉(zhuǎn)錄后加工過程中RNA剪接體的主要成分,參與mRNA前體的加工過程。通常snRNA不是游離存在,而是與蛋白質(zhì)結(jié)合成復合物,成為小核核糖核蛋白顆粒SnRNP。snRNA不參與蛋白質(zhì)合成活動,其在RNA進行加工方面具有重要作用。

4、snoRNA:核仁小RNA,是由內(nèi)含子編碼的RNA。已證明有多種功能,反義snoRNA指導rRNA核糖甲基化。核仁小RNA與其它RNA的處理和修飾有關(guān),如核糖體和剪接體核小RNA、gRNA等。

5、piRNA:與Piwi蛋白相作用的RNA稱為piRNAs。piRNAs在基因組中顯示出與眾不同的定位類型,主要成群地分為長20–90kb的基因簇,其中的長片斷的小分子RNA只能來源于單鏈。

6、microRNA:微小RNA,是真核生物中廣泛存在的一種長約21到23個核苷酸的RNA分子,可調(diào)節(jié)其他基因的表達。miRNA來自一些從DNA轉(zhuǎn)錄而來,但無法進一步轉(zhuǎn)譯成蛋白質(zhì)的RNA(屬于非編碼RNA)。miRNA通過與靶信使核糖核酸(mRNA)特異結(jié)合,從而抑制轉(zhuǎn)錄后基因表達, 在調(diào)控基因表達、細胞周期、生物體發(fā)育時序等方面起重要作用。

7、circRNAs:指真核生物細胞中所具有的大量的、由外顯子向后剪切形成的環(huán)形RNA.目前這類環(huán)形RNA可以分為兩大類,一類是完全由外顯子序列組成的外顯子環(huán)形RNAs以及既有外顯子又有內(nèi)含子序列組成的外顯子內(nèi)含子環(huán)形RNAs.

8、gRNA:向?qū)NA,是作用于動質(zhì)體體內(nèi)一種稱為RNA編輯的后轉(zhuǎn)錄修飾過程中。也是一種小型非編碼RNA。可與pre-mRNA配對,并在其中插入一些尿嘧啶(U),產(chǎn)生具有作用的mRNA。向?qū)NA編輯的RNA分子,長度大約是60~80個核苷酸,是由單獨的基因轉(zhuǎn)錄的,具有3'寡聚U的尾巴,中間有一段與被編輯mRNA精確互補的序列,5'端是一個錨定序列,它同非編輯的mRNA序列互補。

9、總RNA的提取:目前常用的方法是異硫氰酸胍-苯酚抽提法。Trizol試劑是使用最廣泛的抽提RNA的專用試劑,主要由苯酚和異硫氰酸胍組成,可以迅速破壞細胞結(jié)構(gòu),使存在于細胞質(zhì)基質(zhì)和核內(nèi)的RNA釋放出來,使得核糖體蛋白與RNA分子分離,還能保證RNA的完整性。提取RNA時,首先用液氮研磨材料,勻漿,加入Trizol試劑,進一步破碎細胞并溶解細胞成分。然后加入氯仿抽提,離心,分離水相和有機相,收集含有RNA的水相,通過異丙醇沉淀,獲得較純的總RNA,用于下一步mRNA的純化。

10、mRNA的純化:通常采用寡(dT)-纖維素柱層析法獲得高純度的mRNA。該方法利用mRNA3’末端含有poly(A)的特點,當RNA流經(jīng)寡(dT)纖維素柱時,在高鹽緩沖液的作用下,mRNA被特異性得結(jié)合在柱上,再用低鹽溶液或蒸餾水洗脫mRNA。經(jīng)過兩次寡(dT)纖維素柱后可得到較高純度的mRNA。

11、cDNA的合成:cDNA的合成包括第一鏈和第二鏈cDNA的合成。第一鏈cDNA的合成是以mRNA為模板,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再由反轉(zhuǎn)錄酶催化,該酶合成DNA時需要引物引導,常用的引物是oligo(dT)。第二鏈cDNA的合成是以第一鏈為模板,由DNA聚合酶催化,常用RNaseH切割mRNA-cDNA雜合鏈中的mRNA序列所產(chǎn)生的小片段為引物合成第二條cDNA的片段,再通過DNA連接酶的作用鏈接成完整的DNA鏈。

12、原位雜交技術(shù):是用標記的核酸探針,經(jīng)放射自顯影或非放射檢測體系,在組織、細胞、間期核及染色體上對核酸進行定位和相對定量研究的一種手段,通常分為RNA原位雜交和染色體原位雜交兩大類。

13、RNA原位雜交:利用放射性或非放射性標記的特異性探針與被固定的組織切片反應,若細胞中存在與探針互補的mRNA分子,兩者雜交產(chǎn)生雙鏈RNA,就可通過檢測放射性標記或經(jīng)酶促免疫顯色,對該基因的表達產(chǎn)物在細胞水平上做出定性定量分析。

14、熒光原位雜交:首先對核苷酸探針做特殊的修飾和標記,然后用原位雜交法與靶染色體或DNA上特定序列結(jié)合,再通過與熒光素分子相偶聯(lián)的單克隆抗體來確定該DNA序列在染色體上的位置。該技術(shù)不需要放射性同位素,周期短,靈敏度高。


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