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蛋白組學(xué)資訊:百趣協(xié)助,非小細(xì)胞癌轉(zhuǎn)移機(jī)制新解

2022-07-29 08:40 作者:百趣代謝組學(xué)  | 我要投稿

百趣生物iTRAQ/TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組研究是對一個基因組表達(dá)的全部蛋白質(zhì)或一個復(fù)雜混合體系內(nèi)所有蛋白質(zhì)進(jìn)行標(biāo)記,利用標(biāo)記試劑中的二級報(bào)告離子來對蛋白進(jìn)行精確鑒定和定量。接下來就跟著阿趣一起解讀吧。

文章標(biāo)題:Profilin 1 Induces Tumor Metastasis byPromoting Microvesicle Secretion Through the ROCK 1/p-MLC Pathway in Non-SmallCell Lung Cancer

發(fā)表期刊:Frontiers in Pharmacology

發(fā)表時(shí)間:2022.5

影響因子:5.988

合作單位:中南大學(xué)湘雅醫(yī)院

百趣生物提供服務(wù):TMT標(biāo)記蛋白組

01摘要

Profilin 1(PFN1)是一種肌動蛋白結(jié)合蛋白,在幾種癌癥的轉(zhuǎn)移中發(fā)揮著不同的作用;然而,其在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)轉(zhuǎn)移中的作用仍不清楚。作者應(yīng)用TMT標(biāo)記定量蛋白組技術(shù)研究其誘導(dǎo)腫瘤轉(zhuǎn)移的機(jī)制。蛋白質(zhì)組學(xué)分析顯示PFN1參與微泡(MV)分泌。與非轉(zhuǎn)移性NSCLC患者的血清相比,轉(zhuǎn)移性NSCLC患者的血清中MV的豐度增加。體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)均表明,PFN1可以增加MV分泌,并且源自PFN1過表達(dá)細(xì)胞的MV顯著促進(jìn)NSCLC轉(zhuǎn)移。同樣發(fā)現(xiàn)PFN1可以與ROCK1相互作用并增強(qiáng)其激酶活性以促進(jìn)肌球蛋白輕鏈(MLC)磷酸化從而促進(jìn)MV分泌。ROCK1的抑制降低了MV的分泌并部分逆轉(zhuǎn)了PFN1誘導(dǎo)的NSCLC轉(zhuǎn)移的促進(jìn)作用。總的來說,這些發(fā)現(xiàn)表明PFN1調(diào)節(jié)MV分泌以促進(jìn)NSCLC轉(zhuǎn)移。PFN1和MV代表了NSCLC轉(zhuǎn)移的潛在預(yù)測因子或治療靶點(diǎn)。

02實(shí)驗(yàn)結(jié)果1.PFN1與NSCLC 轉(zhuǎn)移相關(guān),可促進(jìn)NSCLC細(xì)胞體外遷移

為了研究PFN1在NSCLC中的作用,作者采用IHC方法、組織芯片定量等實(shí)驗(yàn),表明了PFN1參與了NSCLC的轉(zhuǎn)移,并構(gòu)建細(xì)胞系,通過RT-qPCR和Western檢測過表達(dá)和敲除的影響,后又采用傷口愈合和Transwell遷移試驗(yàn)來確定PFN1對遷移的影響。


圖1. NSCLC組織PFN1的IHC分析圖像/Kaplan–Meier生存分析

2.PFN1可促進(jìn)NSCLC中Mv的分泌

為了進(jìn)一步研究EV和PFN1 OE細(xì)胞之間的分子差異以及影響NSCLC的可能信號通路。作者利用基于蛋白質(zhì)組學(xué)的方法(TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué))描述它們之間的蛋白質(zhì)水平。差異蛋白質(zhì)(DEPs)篩選條件為P值<0.05和倍數(shù)變化≤0.83或倍數(shù)變化≥1.2。結(jié)果確定了581個差異蛋白質(zhì),其中327個上調(diào)的蛋白質(zhì)和254個下調(diào)的蛋白質(zhì)(圖2)。


圖2. 差異表達(dá)蛋白分析熱圖

接下來,利用富集分析來確定這些DEPs是否可以指向任何特定的生物學(xué)功能,從而可以深入了解它們在生物學(xué)功能上的差異。GO注釋表明DEPs涉及蛋白質(zhì)結(jié)合、細(xì)胞成分組織或生物發(fā)生和細(xì)胞器組織(圖3)。大多數(shù)不同表達(dá)的蛋白與細(xì)胞器相關(guān),這與PFN1在細(xì)胞膜運(yùn)輸中的作用相一致。同源蛋白群簇(COG/KOG)分析顯示,DEPs參與了翻譯后修飾、蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)換、伴侶蛋白、細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸、分泌、囊泡轉(zhuǎn)運(yùn)和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制(圖4)。通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析,我們推斷PFN1可能通過蛋白相互作用和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)參與細(xì)胞外囊泡分泌,進(jìn)而促進(jìn)NSCLC轉(zhuǎn)移。

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圖3. 差異表達(dá)蛋白的GO富集分析


圖4. 差異表達(dá)蛋白的COG/KOG分析

由于PFN1在細(xì)胞膜運(yùn)輸中起著重要作用,而MVs是癌癥轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵介質(zhì),我們從臨床樣本的血清中提取了細(xì)胞外囊泡(MVs和外泌體)。通過一系列實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)PFN1可能調(diào)控MLC的磷酸化,而磷酸化可以調(diào)節(jié)MV的分泌。

3.來自PFN1OE細(xì)胞的MVs促進(jìn)了NSCLC細(xì)胞的遷移

Mv是癌癥轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵介質(zhì)。作者收集了轉(zhuǎn)移性(n=25)和非轉(zhuǎn)移性(n=20)肺癌患者的血清樣本,并提取了Mv(圖5)。作者通過一系列過表達(dá),以及傷口愈合和Transwell遷移實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)PFN1可能通過誘導(dǎo)MV分泌促進(jìn)NSCLC轉(zhuǎn)移。

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圖5. 為確定PFN1在腫瘤轉(zhuǎn)移中的作用而建立的轉(zhuǎn)移瘤小鼠模型示意圖

4.PFN1通過提高M(jìn)V的分泌來促進(jìn)體內(nèi)NSCLC的轉(zhuǎn)移為了進(jìn)一步研究PFN1在NSCLC轉(zhuǎn)移中的作用,我們通過心內(nèi)注射H1299NSCLC細(xì)胞建立了腫瘤轉(zhuǎn)移的小鼠模型,結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了PFN1在NSCLC轉(zhuǎn)移中的作用(圖6)。

圖6. HE染色小鼠模型肺組織的代表性圖像/肺組織中PFN1和p-MLC表達(dá)

5.PFN1促進(jìn)MLC磷酸化的機(jī)制作者通過敲低、過表達(dá)、co-IP、Western blot、免疫熒光、流式細(xì)胞術(shù)等實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)PFN1可以與ROCK1相互作用,增強(qiáng)其激酶活性,并間接促進(jìn)MLC磷酸化,最終誘導(dǎo)MV分泌。ROCK1抑制劑Y27632部分逆轉(zhuǎn)了PFN1促進(jìn)MLC磷酸化和MV分泌的作用(圖7)。

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圖7. western印跡法測定PFN1過度表達(dá)(A)/敲除(B)后的蛋白表達(dá)/PF

6.ROCK1抑制劑Y27632在體內(nèi)和體外均部分逆轉(zhuǎn)了PFN1對NSCLC轉(zhuǎn)移的影響創(chuàng)面愈合實(shí)驗(yàn)顯示(圖8),Y27632處理的過表達(dá)PFN1的細(xì)胞遷移減少到接近EV細(xì)胞.接下來,將過表達(dá)PFN1的細(xì)胞來源的MVs添加到y(tǒng)27632處理的細(xì)胞中,發(fā)現(xiàn)Y27632并沒有逆轉(zhuǎn)過表達(dá)PFN1的細(xì)胞來源的MVs誘導(dǎo)的遷移,從Transwell遷移實(shí)驗(yàn)中也得到了類似的結(jié)果,此外也用小鼠模型驗(yàn)證了這些結(jié)果。


圖8. 傷口愈合實(shí)驗(yàn)評估Y27632的療效

03總結(jié)

研究結(jié)果表明,PFN1是關(guān)鍵的肌動蛋白調(diào)節(jié)蛋白,調(diào)控肌動蛋白細(xì)胞骨架的關(guān)鍵蛋白之一,它通過ROCK/p-MLC通路促進(jìn)MV的釋放,從而促進(jìn)NSCLC的轉(zhuǎn)移。因此,PFN1可能是NSCLC轉(zhuǎn)移的潛在治療靶點(diǎn)。通過減少M(fèi)Vs的釋放,有可能會部分逆轉(zhuǎn)PFN1過表達(dá)誘導(dǎo)的NSCLC細(xì)胞遷移。本研究為靶向轉(zhuǎn)移治療NSCLC提供了一種潛在的新方法,值得進(jìn)一步研究。

文/阿趣代謝組學(xué)


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