? ? ? ? 小學六年級的進藤光（12歲）為了賺些零用錢，和青梅竹馬的藤崎明跑到爺爺家閣樓尋寶，偶然翻出了一個舊棋盤。接觸棋盤的一瞬間，附身于棋盤中的平安時代棋士——藤原佐為的靈魂進入了進藤光的體內(nèi)。佐為將圍棋視為生命，在他的熏陶下，進藤光也逐漸對圍棋產(chǎn)生了興趣。

? ? ? ?進藤光在圍棋會所結識了棋壇名人之子——塔矢亮（12歲）。為了測試佐為的實力，進藤光貿(mào)然與塔矢亮對弈，結果小勝對手。他不知道塔矢亮的身份，誤以為佐為棋力平常，對此深為不滿。然而塔矢亮卻大受打擊，失意至極。數(shù)日后，塔矢亮再次向進藤光挑戰(zhàn)，雖然他對進藤光藐視圍棋的態(tài)度十分氣憤，但是無奈再次慘敗在佐為手下。

? ? ? ?進藤光應朋友之邀，前往葉瀨中學參加校慶活動。他冒充初中生加入葉瀨中學團隊參加校際圍棋賽。在團體賽的決賽中，借助佐為的力量連克強敵，結果葉瀨中學力挫名校海王中學，奪得了冠軍?？上в腥私野l(fā)進藤光還是個小學生，因此被大賽取消了名次。

? ? ? ?不久后，進藤光升入葉瀨中學，并加入了圍棋部。與此同時，塔矢亮也考入了海王中學，為了和進藤光對局，他專程前往葉瀨中學挑戰(zhàn)。但是，進藤光深知自己遠遠不是塔矢亮的對手，斷然回絕。塔矢亮得知進藤光即將參加校際圍棋比賽后，為了與他一決高下，不惜加入海王中學圍棋部。

? ? ? 進藤光發(fā)現(xiàn)同年級的三谷棋藝出眾，便邀請他加入圍棋部。三谷在圍棋會所與大人賭博，并且作弊騙錢。不料反被騙走1萬日元。進藤光借助佐為的力量，幫助三谷奪回了賭金。在他的不懈努力下，三谷終于同意參加校際圍棋團體賽。塔矢亮在得知進藤光將在團體賽中擔任葉瀨中學末將后，以退部為要挾獲得海王中學末將資格。

? ? ? ?圍棋大賽上，三谷出任主帥，筒井、進藤光分別擔任二將、三將。進藤光與塔矢亮第三次交鋒，在猶豫不決中進藤光最終決定親自與塔矢亮對弈，以了解自己與對手的差距。但由于水平差距懸殊，結果以慘敗告終。筒井與三谷也不敵對手，葉瀨中學在第二回合便被淘汰出局。塔矢亮對進藤光的實力大為失望，決意參加職業(yè)棋士考試。

? ? ? ?暑假，為了幫佐為尋找下棋對手，進藤光學會網(wǎng)絡圍棋并化名為sai四處挑戰(zhàn)。sai的高超棋藝使其名揚海外。國際業(yè)余圍棋賽在日本舉行，選手們紛紛詢問網(wǎng)上神秘高手sai的真正身份，賽場一片嘩然。塔矢亮之后向sai發(fā)起挑戰(zhàn)，卻驚奇的發(fā)現(xiàn)sai的手法與進藤光如出一轍。為了不影響比賽，塔矢亮果斷的中途投降，要求改日再戰(zhàn)。

? ? ? ?職業(yè)棋士考試第一天，塔矢亮不惜放棄首戰(zhàn)，如約與sai展開對局。他雖全力以赴步步為營，卻無奈佐為的棋藝出神入化，結果再次告負。塔矢亮懷疑 sai的真實身份便是進藤光，又聽說曾有人在網(wǎng)吧見過進藤光，急忙趕去確認。進藤光矢口否認自己曾在網(wǎng)上下棋，暗示塔矢亮不要追逐佐為的幻象，并正式向其發(fā)出挑戰(zhàn)，塔矢亮不屑而去。

? ? ? ?進藤光棋力日漸增強。一天，他偶遇海王中學圍棋部會長岸本，岸本的一席話驚醒了進藤光，使他決定參加院生考試。然而，一旦成為院生便無法參加業(yè)余比賽，因此激起了三谷的不滿。在加賀的建議下，進藤光以一敵三，同時與加賀、筒井、三谷對局，結果2勝1負。他告別了圍棋部，邁向新的起點。

? ? ? 院生考試當天，進藤光因為心情緊張，未能發(fā)揮出理想的水平。但主考老師得知他學習圍棋不過一年時間，對其進步之快十分吃驚，并從進藤光以一敵三的棋譜中發(fā)現(xiàn)他有過人的素質(zhì)，故破格給予其合格。

? ? ? 此時，塔矢亮已晉升為初段，他聽說進藤光成為院生，心中再次燃起昂揚斗志，決定遠遠將光拋在身后。與王座的比賽中，他為向光展現(xiàn)兩人之間的實力差距，面對強敵毫不畏懼，步步緊逼鋒芒畢露，令王座陷入苦戰(zhàn)。

? ? ? ?一年一度的幼獅戰(zhàn)即將到來，為了能與塔矢亮再次交鋒，身為院生二組最后一名的進藤光在三個月內(nèi)經(jīng)過努力晉升至一組16名，獲得了幼獅戰(zhàn)的參賽資格。在比賽中，進藤光巧妙地化惡手為妙手，令對手陷入苦戰(zhàn)。雖然棋差一招未能出線，但他真切的感受到了自身的成長，塔矢亮也從殘局中發(fā)現(xiàn)，進藤光的實力已經(jīng)今非昔比。

? ? ? ?參加職業(yè)棋手考試，是院生們的第一目標，伊角、和谷等人在院生中名列前茅，可免預賽參加正式考試。進藤光由于過于緊張，在預賽前兩場比賽中連續(xù)告負，但此后狀態(tài)逐漸恢復，最后一場比賽輪空不戰(zhàn)而勝，以3勝2負的成績通過預賽。和谷伊角為幫助進藤光積累經(jīng)驗，3人組隊前往各個圍棋會所挑戰(zhàn)，進藤光受益匪淺。

? ? ? ?正式考試中，進藤光沉著應戰(zhàn)，戰(zhàn)績位居前列。決戰(zhàn)在積分靠前的越智、伊角、和谷和進藤光之間展開。伊角的無意犯規(guī)，使進藤光違心地獲得了1分。伊角情緒低落，連輸2輪，但在與越智的比賽中再度燃起斗志并取勝。塔矢亮為了解進藤光的實力，協(xié)助越智展開特訓，不料進藤光奇兵突襲，打亂了越智的陣腳。最終，進藤光通過了職業(yè)考試。

? ? ? ?進藤光沒有想到，自己首場職業(yè)比賽的對手竟是塔矢亮，不料由于塔矢名人急病臥床，亮未能參加比賽。進藤光前往醫(yī)院探望名人，為滿足佐為的心愿，他請求名人和sai在網(wǎng)上一決勝負。名人答應了進藤光的挑戰(zhàn)，與佐為在網(wǎng)上展開了一場空前絕后的鏖戰(zhàn)。兩人棋逢對手，戰(zhàn)局難分高下，最后佐為棋高一著，中盤取勝，完成了夙愿。

? ? ? 佐為發(fā)現(xiàn)，自己在人間的時日已經(jīng)無多，他多次提醒進藤光，希望在最后的一段時間里能一直跟進藤光下棋，但進藤光一再認為佐為只是杞人憂天，并沒有理會佐為的話。一天，進藤光在與佐為下棋時突然發(fā)現(xiàn)整日與自己形影不離的佐為失去了蹤影。他以為佐為只是去找秀策，便跑到所有跟秀策有關的地方，一個接著一個地找，卻沒有結果。進藤光茫然若失，在棋院看到秀策（其實是佐為）的棋譜后，他終于明白為什么秀策一直讓佐為下棋——因為秀策知道佐為的強大而甘愿讓他下棋，而自己卻一直沒有認識到這一點，一直一直……進藤光覺得如果自己再下棋的話，佐為就不會再回來，所以他決意不再下棋。

? ? ? ?轉(zhuǎn)眼再一次幼獅戰(zhàn)的來臨，塔矢亮為正常暌違依舊的戰(zhàn)斗早已摩拳擦掌，卻不料此時的進藤光已經(jīng)放棄了任何比賽。賽后，他去找進藤光，得到的答案是他再也不下圍棋。任他怎么怒罵和勸告都沒有用……

? ? ? ?伊角從中國棋院回到日本，前來探望進藤光，他再三要求與進藤光對局，終于打動了進藤光。手執(zhí)棋子的剎那進藤光不禁淚如泉涌，他突然明白了，原來佐為早已融入了自己的棋中。進藤光知道見佐為的唯一方法就是下棋時，他重新下起圍棋。

? ? ? ?進藤光回到闊別數(shù)月的職業(yè)棋壇，再次與塔矢亮交鋒。這一戰(zhàn)雖然告負，但塔矢亮從進藤光的身上，清楚地看見了佐為的身影。兩位天才少年終于冰釋前嫌，結為畢生的競爭對手。

? ? ? 圍棋少年的故事從這里再度展開……