此前我們已經(jīng)講過了如何使用R語言計(jì)算兩列數(shù)據(jù)相關(guān)性的分析方法，今天，我們來看一種檢驗(yàn)兩個矩陣相關(guān)關(guān)系的方法——Mantel?test方法，這種分析方法可用在植物微生物群落與生態(tài)環(huán)境之間相關(guān)性的檢驗(yàn)以及人體腸道微生物群落與人體疾病相關(guān)性檢驗(yàn)等領(lǐng)域。話不多說，直接邁入正文！

加載包

1）設(shè)置工作目錄

2）安裝、加載R包

加載數(shù)據(jù)

環(huán)境因子的相關(guān)性分析及展示

Mantel test分析

1）計(jì)算OTU與環(huán)境因子之間的mantel test的r值和p值

2）定義標(biāo)簽

繪圖

參考：

1）https://zhuanlan.zhihu.com/p/507384776

2）https://zhuanlan.zhihu.com/p/110501058

源碼及作圖數(shù)據(jù)可在公眾號后臺回復(fù)“mantel test”獲取?。?！

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