耶穌會(huì)在明朝做間諜從壬辰倭亂就開始了，當(dāng)時(shí)的傳教士已經(jīng)潛入明朝，根據(jù)傳教士發(fā)給豐臣秀吉的報(bào)告，明朝人不堪一擊，日本可輕松吞并中國，這給了豐臣秀吉相當(dāng)大的勇氣。

日本的資料里面記載了耶穌會(huì)曾給豐臣秀吉提供了一份明軍戰(zhàn)斗力孱弱的報(bào)告。說幾十個(gè)日本浪人就能橫掃南直隸。

這份耶穌會(huì)報(bào)告正是葡萄牙籍傳教士羅明堅(jiān)發(fā)來的，羅明堅(jiān)一邊和明朝人談笑風(fēng)生，一邊把明朝的詳細(xì)情況發(fā)給日本，為日本攻打明朝做積極準(zhǔn)備。

壬辰倭亂之后，耶穌會(huì)間諜成功打入了明朝宮廷，明朝的所有情報(bào)都被耶穌會(huì)傳教士傳與李自成后金共享。

根據(jù)耶穌會(huì)傳教士的研究，中國歷史上改朝換代是比較常見的情況，所以傳教士在明朝各地放出謠言，其信徒大肆鼓吹明朝氣數(shù)已盡，這給了各地野心勃勃的人士以強(qiáng)烈的鼓舞，任何常見或不常見的自然現(xiàn)象，都被傳教士強(qiáng)行聯(lián)系上明朝的氣運(yùn)終結(jié)，這讓當(dāng)時(shí)的很多普通明國人，認(rèn)為明朝的可能滅亡，也是很自然的事情。