代謝組差異閾值
代謝組學(xué)是對(duì)生物體所有內(nèi)源性小分子量代謝物(通常指分子量小于1000Da的物質(zhì),如氨基酸、多肽、糖類(lèi)、脂肪酸、核苷、核苷酸、有機(jī)酸、花青素、脫落酸和類(lèi)固醇等)進(jìn)行定性定量分析的一門(mén)新興科學(xué),旨在尋找代謝物與生理病理變化相關(guān)關(guān)系,進(jìn)而揭示生命活動(dòng)變化的本質(zhì),解析生物學(xué)問(wèn)題。代謝組學(xué)分析主要通過(guò)尋找不同組間的關(guān)鍵差異代謝物來(lái)闡明生物體的代謝通路以及生理病變機(jī)制。因此,差異代謝物的篩選是代謝組分析中最重要的內(nèi)容,也是進(jìn)行后續(xù)的代謝通路分析以及多組學(xué)分析等的關(guān)鍵一步。
目前,主要通過(guò)單變量統(tǒng)計(jì)分析和多元統(tǒng)計(jì)分析結(jié)合相關(guān)軟件實(shí)現(xiàn)差異代謝物的分析。單變量統(tǒng)計(jì)分析如Student’s T檢驗(yàn)和ANOVA檢驗(yàn),多元統(tǒng)計(jì)分析如PL-DA或OPLS-DA。根據(jù)Student’s t檢驗(yàn)和ANOVA檢驗(yàn)的P值以及PL-DA或OPLS-DA的VIP值進(jìn)行不同比較組間的差異代謝物篩選,P值和VIP值需要滿足一定的閾值,通常設(shè)定P值小于0.05,VIP值大于等于1。
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