疏水相互作用層析作為對(duì)其它根據(jù)蛋白電荷、大小、生物特異性識(shí)別等來進(jìn)行分離的方法的有效補(bǔ)充， 廣泛的用于蛋白純化。這種技術(shù)是樣品進(jìn)行硫酸銨沉淀后理想的下游純化步驟（硫酸銨沉淀經(jīng)常用于起始步驟樣品的濃縮和清潔）或者是在離子交換層析后的進(jìn)行下游純化。在這兩種情況下，樣品都包含高濃度的鹽，可以不經(jīng)過或經(jīng)過很少的處理，直接上樣到疏水層析柱上。高濃度的鹽增強(qiáng)了樣品中疏水組分和層析介質(zhì)的相互作用。在分離過程中，樣品被純化，并被分別以小體積洗脫下來，因此，濃縮了樣品以便直接上樣到凝膠過濾層析，或者在緩沖液交換后進(jìn)行離子交換層析。在純化方案中，疏水相互作用層析可以用于捕獲、中度純化、精細(xì)純化。GE醫(yī)療集團(tuán)的介質(zhì)可以用于實(shí)驗(yàn)室小規(guī)模分離，乃至公斤級(jí)產(chǎn)品的生產(chǎn)。