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TBtools | 批量計算蛋白分子量、等電點、不穩(wěn)定系數(shù)、脂溶指數(shù)和親水指數(shù)

2023-08-29 15:34 作者:蜉蝣無所  | 我要投稿

注:原文為陳程杰老師編輯,此處僅為記錄。

原文地址:www.jianshu.com/p/847f0c597405


Expasy網(wǎng)站中的ProtParam程序可進行蛋白分子量、等電點、不穩(wěn)定系數(shù)、脂溶指數(shù)和親水指數(shù)分析,但該程序僅能單個序列進行分析,CJ-Chen在TBtools上推出Protein Paramter Calc爬蟲程序,可實現(xiàn)批量蛋白序列處理,但該程序為避免Expasy網(wǎng)站服務(wù)器崩潰,對其進行限速,我對比了150條序列,大概耗時3 min。與Expasy網(wǎng)站結(jié)果對比檢測,TBtools跑出的結(jié)果沒有問題,二者完全一致。

使用路徑:

TBtools軟件中Other——Phylogenetics——Protein Paramter Calc (ProtParam-based)

使用方法:

輸入蛋白序列,輸出文件,compute,等待。

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