藍藻是原核生物，又叫藍綠藻或藍細菌;大多數(shù)藍藻的細胞壁外面有膠質(zhì)衣，又叫粘藻。在藻類中，藍藻是最簡單、最原始的單細胞生物，如微囊藻、念珠藻、魚腥藻等。

藍藻沒有細胞核，細胞中央有核物質(zhì)，通常呈顆粒狀或網(wǎng)狀，色素均勻的分布在細胞質(zhì)中。核物質(zhì)沒有核膜和核仁，具有核的功能，故稱為原核(或擬核)。藍藻中有環(huán)狀DNA質(zhì)粒，擔當運載體的作用。

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