醫(yī)學(xué)影像相關(guān)開源數(shù)據(jù)集資源匯總

CT 醫(yī)學(xué)圖像
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該數(shù)據(jù)集旨在允許測試不同的方法來檢查與使用對比度和患者年齡相關(guān)的 CT 圖像數(shù)據(jù)的趨勢?;舅枷胧亲R別與這些特征密切相關(guān)的圖像紋理、統(tǒng)計(jì)模式和特征,并可能構(gòu)建簡單的工具,在這些圖像被錯(cuò)誤分類時(shí)自動對其進(jìn)行分類(或查找可能是可疑情況、錯(cuò)誤測量或校準(zhǔn)不良機(jī)器的異常值)

MedMNIST醫(yī)學(xué)圖像分割評估
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MedMNIST,這是 10 個(gè)預(yù)處理的醫(yī)學(xué)開放數(shù)據(jù)集的集合。MedMNIST 經(jīng)過標(biāo)準(zhǔn)化處理,可在輕量級 28x28 圖像上執(zhí)行分類任務(wù),無需背景知識。它涵蓋了醫(yī)學(xué)圖像分析中的主要數(shù)據(jù)模式,在數(shù)據(jù)規(guī)模(從 100 到 100,000)和任務(wù)(二元/多類、序數(shù)回歸和多標(biāo)簽)上具有多樣性。MedMNIST 可用于教育目的、快速原型設(shè)計(jì)、多模式機(jī)器學(xué)習(xí)或醫(yī)學(xué)圖像分析中的 AutoML。此外,MedMNIST Classification Decathlon 旨在對所有 10 個(gè)數(shù)據(jù)集上的 AutoML 算法進(jìn)行基準(zhǔn)測試

多標(biāo)簽視網(wǎng)膜疾病 (MuReD) 數(shù)據(jù)集
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多標(biāo)簽視網(wǎng)膜疾?。∕uReD)數(shù)據(jù)集,使用從三個(gè)不同的最先進(jìn)來源(即 ARIA、STARE 和 RFMiD 數(shù)據(jù)集)收集的圖像,并執(zhí)行一系列后處理確保圖像質(zhì)量的處理步驟、要分類的廣泛疾病以及每個(gè)疾病標(biāo)簽有足夠數(shù)量的樣本。MuReD 數(shù)據(jù)集由 2208 張圖像組成,具有 20 個(gè)不同的標(biāo)簽,圖像質(zhì)量和分辨率各不相同。同時(shí),確保數(shù)據(jù)的最低質(zhì)量,每個(gè)標(biāo)簽有足夠數(shù)量的樣本。

瘧疾細(xì)胞圖像數(shù)據(jù)集
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皮膚癌 MNIST:HAM10000
下載鏈接:http://suo.nz/33n6Xy該數(shù)據(jù)集收集了來自不同人群的皮膚鏡圖像,通過不同的方式獲取和存儲。最終數(shù)據(jù)集包含 10015 張皮膚鏡圖像,可用作學(xué)術(shù)機(jī)器學(xué)習(xí)目的的訓(xùn)練集。案例包括色素病變領(lǐng)域所有重要診斷類別的代表性集合:光化性角化病和上皮內(nèi)癌/鮑溫氏病 (akiec)、基底細(xì)胞癌 (bcc),超過50%的病變是通過組織病理學(xué)(histo)證實(shí)的,其余病例的ground truth要么是后續(xù)檢查(follow_up),要么是專家共識(consensus),要么是活體共聚焦顯微鏡(confocal)證實(shí). 數(shù)據(jù)集包括具有多個(gè)圖像的病變,可以通過 HAM10000_metadata 文件中的 lesion_id 列進(jìn)行跟蹤。

乳房組織病理學(xué)圖像
下載鏈接:http://suo.nz/347Jt1原始數(shù)據(jù)集包含以 40 倍掃描的 162 個(gè)完整的乳腺癌 (BCa) 標(biāo)本幻燈片圖像。從中提取了 277,524 個(gè)大小為 50 x 50 的補(bǔ)?。?98,738 個(gè) IDC 負(fù)值和 78,786 個(gè) IDC 正值)。每個(gè)補(bǔ)丁的文件名格式為:u_xX_yY_classC.png — > example 10253_idx5_x1351_y1101_class0.png。其中 u 是患者 ID (10253_idx5),X 是裁剪此補(bǔ)丁的 x 坐標(biāo),Y 是裁剪此補(bǔ)丁的 y 坐標(biāo),C 表示類,其中 0 是非 IDC 和1 是數(shù)據(jù)中心。

胸部 X 光圖像(肺炎)
下載鏈接:http://suo.nz/3aXYPg數(shù)據(jù)集分為 3 個(gè)文件夾(train、test、val)并包含每個(gè)圖像類別(肺炎/正常)的子文件夾。有 5,863 張 X 射線圖像 (JPEG) 和 2 個(gè)類別(肺炎/正常)。胸部 X 光圖像(前后位)選自廣州市婦女兒童醫(yī)療中心 1 至 5 歲兒科患者的回顧性隊(duì)列。

白內(nèi)障數(shù)據(jù)集
下載鏈接:http://suo.nz/2cOidH用于白內(nèi)障檢測的白內(nèi)障和正常眼睛圖像數(shù)據(jù)集。
惡性與良性皮膚癌
下載鏈接:http://suo.nz/2kkvio該數(shù)據(jù)集包含良性皮膚痣和惡性皮膚痣圖像的平衡數(shù)據(jù)集。數(shù)據(jù)由兩個(gè)文件夾組成,每個(gè)文件夾包含兩種痣的 1800 張圖片 (224x244)。