高新企業(yè)申請流程如下：
　　1.企業(yè)根據(jù)《認(rèn)定辦法》和《工作指引》進(jìn)行自我評(píng)價(jià)，初步判斷是否達(dá)到認(rèn)定條件的要求。
　　2.企業(yè)通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交至認(rèn)定機(jī)構(gòu)。認(rèn)定機(jī)構(gòu)核對(duì)企業(yè)注冊信息，在網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)上確認(rèn)激活后，企業(yè)可以開展后續(xù)申報(bào)工作。
　　3.企業(yè)登錄"高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)"，按要求填寫《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定申請書》，通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交至認(rèn)定機(jī)構(gòu)，并向認(rèn)定機(jī)構(gòu)提交國家高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定材料。
　　4.認(rèn)定機(jī)構(gòu)收到企業(yè)申報(bào)材料后，從專家?guī)熘谐槿≈辽?名評(píng)審專家（其中技術(shù)專家不少于60%，并至少有1名財(cái)務(wù)專家）組成專家組。進(jìn)行審查
　　5.認(rèn)定機(jī)構(gòu)根據(jù)專家組評(píng)審意見，對(duì)申請企業(yè)申報(bào)材料進(jìn)行綜合評(píng)審（可視情況對(duì)部分企業(yè)進(jìn)行實(shí)地核查），提出認(rèn)定企業(yè)名單，報(bào)領(lǐng)導(dǎo)小組備案，報(bào)送時(shí)間不得晚于每年11月底。
　　6.經(jīng)認(rèn)定報(bào)備的企業(yè)名單，由領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室在"高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作網(wǎng)"公示10個(gè)工作日。有異議的，須以書面形式實(shí)名向領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室提出，由認(rèn)定機(jī)構(gòu)核實(shí)處理；領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室可對(duì)報(bào)備企業(yè)進(jìn)行隨機(jī)抽查，對(duì)存在問題的企業(yè)交由認(rèn)定機(jī)構(gòu)核實(shí)情況，提出處理建議。