【ROSALIND】【練Python,學(xué)生信】02 DNA轉(zhuǎn)錄為RNA

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題目:
DNA轉(zhuǎn)錄為RNA(Transcribing DNA into RNA)
Given: A DNA string tt, which corresponding to a coding strand, having length at most 1000 nt.
所給:一條被命名為tt的DNA編碼鏈,長(zhǎng)度至少為1000個(gè)堿基。
Return: The transcribed RNA string of tt.
需得:由tt經(jīng)轉(zhuǎn)錄得到的RNA鏈。
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測(cè)試數(shù)據(jù)
GATGGAACTTGACTACGTAAATT
測(cè)試輸出
GAUGGAACUUGACUACGUAAAUU
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生物背景
RNA中五碳糖為核糖,堿基有四種,分別為腺嘌呤(adenine,A)、鳥(niǎo)嘌呤(guanine,G)、胞嘧啶(cytosine,C)和尿嘧啶(uracil,U)。信使RNA(mRNA)由DNA的其中一條鏈轉(zhuǎn)錄而來(lái),攜帶遺傳信息并指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成。轉(zhuǎn)錄RNA分子的DNA鏈稱(chēng)為模板鏈,另一條鏈稱(chēng)為編碼鏈。
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思路
題目給出的是編碼鏈,因此只用把T替換為U即為轉(zhuǎn)錄得到的RNA序列。
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Python知識(shí)點(diǎn)
DNA序列是一個(gè)字符串,Python中針對(duì)字符串提供了大量方法可直接調(diào)用,其中“.replace()”方法可用于替換字符。
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代碼
#s = "GATGGAACTTGACTACGTAAATT"
f = open("rosalind_rna.txt",'r')
s = f.read()
r = s.replace('T','U')
print(r)