代謝物鑒定金標(biāo)準(zhǔn)：

什么叫可信代謝物？簡單來講，通過多維度的匹配后能相對較為準(zhǔn)確的得到注釋的代謝物，這些代謝物就可以成為可信代謝物。那么多維度是指的那些維度呢？一般情況下，基于液相色譜質(zhì)譜的非靶向代謝組學(xué)目前鑒定和定性的維度有三個：RT（Retention time）保留時間；MS1（一級質(zhì)譜）；MS2（二級質(zhì)譜）。

接下來給大家介紹一下三個維度的相關(guān)內(nèi)容：

RT：保留時間，是指從進(jìn)樣開始到某一組分濃度達(dá)到最大值所需要的時間；簡單點(diǎn)說，就是該物質(zhì)的實(shí)際出峰時間，理論上來說，相對穩(wěn)定的色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀，在色譜柱以及流動相等體系一致的情況下，單個代謝物的保留時間長時間內(nèi)應(yīng)該穩(wěn)定在某個數(shù)值的較窄波動范圍內(nèi)；?

MS1：一級質(zhì)譜，一般指的是檢測到的帶電離子的質(zhì)荷比，在代謝組學(xué)的質(zhì)譜檢測過程中，一級質(zhì)譜和代謝物的分子離子峰有著密切的關(guān)聯(lián)，通常我們稱此聯(lián)系為離子加和模式，理論分子量通過某種離子加和形式得到的就是我們常說的一級質(zhì)譜（MS1）,在代謝組數(shù)據(jù)中，通常用來評價代謝物鑒定準(zhǔn)確度的一級質(zhì)譜信息為質(zhì)荷比的質(zhì)量精度，即實(shí)際檢測的化合物的MS1和理論上的質(zhì)量數(shù)進(jìn)行質(zhì)量精度的計算，所以一般來說，控制一級質(zhì)譜的質(zhì)量精度就能控制代謝物鑒定的準(zhǔn)確度，質(zhì)量精度越小，誤差越小。

MS2：二級質(zhì)譜：按照一定的規(guī)則進(jìn)行母離子的選擇，再把選擇后的母離子進(jìn)行碰撞打碎后得到的質(zhì)譜碎片即為該母離子的二級質(zhì)譜；目前高分辨質(zhì)譜使用較為常見的母離子選擇的規(guī)則為DDA采集模式，即數(shù)據(jù)依賴性采集模式，采集規(guī)則通常為按照采集到的一級質(zhì)譜（母離子）的信號強(qiáng)度排列，將Top N的一級質(zhì)譜選擇設(shè)置進(jìn)行打碎，再采集其對應(yīng)的二級質(zhì)譜碎片，目前二級質(zhì)譜是高分辨液相色譜質(zhì)譜進(jìn)行代謝物鑒定最常用的維度之一；

經(jīng)典文獻(xiàn)中關(guān)于代謝物鑒定標(biāo)準(zhǔn)的示例：

CELL | 孕婦的新陳代謝可預(yù)測妊娠年齡和分娩時間

文中關(guān)于代謝物鑒定的描述如下所示：

Gut Microbes | 以粘蛋白聚糖為食的活潑瘤胃球菌在腸道和大腦通訊中的作用

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Nature Aging | 極長壽老人宏基因組和代謝組的重塑及其與遺傳和社會經(jīng)濟(jì)因素的關(guān)系

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CELL | COVID-19重癥患者血清蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)生物標(biāo)志物篩選?

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